38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0932 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0932  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 109 aa  221  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0891  cupin 2, barrel  64.22 
 
 		 109 aa  149  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.049809  normal  0.341782 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1707  cupin 2 protein  52.29 
 
 		 109 aa  121  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3718  cupin 2, barrel  50.46 
 
 		 109 aa  114  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.275117 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4087  cupin region  47.66 
 
 		 113 aa  104  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.586416  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5777  hypothetical protein  49.53 
 
 		 111 aa  104  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1257  hypothetical protein  43.93 
 
 		 125 aa  99.8  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3670  cupin 2 domain-containing protein  43.93 
 
 		 111 aa  97.8  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801583 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0361  hypothetical protein  43.93 
 
 		 115 aa  97.8  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.642928  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1894  hypothetical protein  43.93 
 
 		 170 aa  96.7  9e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.04 
 
 		 111 aa  95.5  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.443195 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5772  hypothetical protein  42.99 
 
 		 111 aa  93.6  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1699  hypothetical protein  42.34 
 
 		 111 aa  91.7  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275263  normal  0.0722973 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1304  cupin 2 domain-containing protein  42.99 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0982  cupin 2 domain-containing protein  42.99 
 
 		 110 aa  88.6  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0897  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.99 
 
 		 110 aa  87.8  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5520  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.06 
 
 		 111 aa  87  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0403366  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0517  cupin 2 domain-containing protein  33.04 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622754 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0275  hypothetical protein  30.86 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5186  hypothetical protein  30.86 
 
 		 312 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.41986  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0754  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.18 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1897  cupin region  33.78 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.766925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.08 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2156  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.17 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.888659  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0363  hypothetical protein  25.93 
 
 		 130 aa  45.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.540367  normal  0.422558 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3898  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.08 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2934  cupin 2 domain-containing protein  27.16 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.18 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438384  normal  0.13585 
 
 
-
 
NC_002950  PG0323  hypothetical protein  29.35 
 
 		 109 aa  42.7  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1814  hypothetical protein  28.97 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.255229  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1179  hypothetical protein  25.56 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4358  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.3 
 
 		 112 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.437014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3536  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.86 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.541629  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2777  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0722963  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2471  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.285762  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3698  hypothetical protein  40.58 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0681  hypothetical protein  26.39 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3944  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.5 
 
 		 112 aa  40  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0892017  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>