16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1179 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1179  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  186  5.999999999999999e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.89 
 
 		 111 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.443195 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1699  hypothetical protein  24 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275263  normal  0.0722973 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5772  hypothetical protein  28.89 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1304  cupin 2 domain-containing protein  23.33 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0361  hypothetical protein  30.67 
 
 		 115 aa  47  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.642928  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0891  cupin 2, barrel  25.56 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.049809  normal  0.341782 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0542  cupin 2, barrel  33.82 
 
 		 122 aa  45.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08250  cupin domain-containing protein  24 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0145374  normal  0.40746 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0897  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.78 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0982  cupin 2 domain-containing protein  26.67 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0903  cupin 2 domain-containing protein  24 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730716 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0932  cupin 2 domain-containing protein  25.56 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0359  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.58 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1707  cupin 2 protein  24.14 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3944  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.68 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0892017  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>