14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3944 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3944  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 112 aa  214  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0892017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19880  hypothetical protein  34.48 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0406618  hitchhiker  0.00288351 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1200  cupin 2, barrel  33.33 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0185  pirin domain-containing protein  38.04 
 
 		 312 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0128  Pirin domain protein  38.04 
 
 		 312 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.266704 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4087  cupin region  32.84 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.586416  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4855  pirin domain-containing protein  37.33 
 
 		 312 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0903  cupin 2 domain-containing protein  31.58 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730716 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 		 277 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1965  pirin domain-containing protein  38.67 
 
 		 309 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0444426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1304  cupin 2 domain-containing protein  35.62 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1179  hypothetical protein  23.68 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0754  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.29 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0932  cupin 2 domain-containing protein  32.5 
 
 		 109 aa  40  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>