14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0754 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0754  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 131 aa  251  3e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0932  cupin 2 domain-containing protein  37.18 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19880  hypothetical protein  32.08 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0406618  hitchhiker  0.00288351 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4464  hypothetical protein  30.77 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.289579  normal  0.0112764 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0681  hypothetical protein  31.43 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2471  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.75 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.285762  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2777  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.75 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0722963  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0891  cupin 2, barrel  35.44 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.049809  normal  0.341782 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1033  hypothetical protein  28.79 
 
 		 112 aa  42  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0816  cupin 2 domain-containing protein  31.82 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0914  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.33 
 
 		 112 aa  42  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0259  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.48 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3606  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.51 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.637892  normal  0.27033 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3944  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.29 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0892017  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>