65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0914 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0914  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 
112 aa  229  9e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1966  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.65 
 
 
110 aa  89.4  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.290809  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0495  5'-nucleotidase SurE  36.27 
 
 
214 aa  86.7  9e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0944  cupin 2 domain-containing protein  34.31 
 
 
219 aa  86.7  9e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3898  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.05 
 
 
113 aa  85.1  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0782  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.82 
 
 
115 aa  84  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0960825  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1128  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.54 
 
 
111 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00311434  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1552  cupin 2 domain-containing protein  33.64 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2934  cupin 2 domain-containing protein  34.26 
 
 
111 aa  77  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1603  cupin 2 domain-containing protein  39.53 
 
 
87 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.664487  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.51 
 
 
113 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0351  cupin 2 domain-containing protein  39.13 
 
 
111 aa  73.2  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0323  hypothetical protein  35.64 
 
 
109 aa  72.4  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2188  cupin 2, barrel  35.87 
 
 
126 aa  71.6  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00753726  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1633  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.87 
 
 
121 aa  71.6  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.11 
 
 
110 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0854  hypothetical protein  37.36 
 
 
107 aa  70.9  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.71 
 
 
111 aa  70.5  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.519233  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0802  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.29 
 
 
112 aa  70.1  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1645  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.37 
 
 
112 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125951  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2019  cupin region  34.41 
 
 
114 aa  68.6  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.935126  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0538  cupin 2, barrel  34.78 
 
 
111 aa  68.6  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.426321  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1985  hypothetical protein  35.42 
 
 
111 aa  68.2  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000280772  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0006  hypothetical protein  35.71 
 
 
109 aa  68.2  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2801  cupin 2 domain-containing protein  35.87 
 
 
105 aa  67.4  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.125759  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1718  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 
112 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0346  cupin 2 domain-containing protein  37.63 
 
 
110 aa  67  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000144683  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1205  cupin 2 domain-containing protein  35.48 
 
 
111 aa  66.6  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.710336  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0224  hypothetical protein  36.56 
 
 
110 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0359  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.84 
 
 
118 aa  66.2  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0699  hypothetical protein  29.17 
 
 
121 aa  65.1  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521479  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2229  cupin domain-containing protein  35.35 
 
 
115 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.688365  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2828  cupin 2 domain-containing protein  34.29 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0994  hypothetical protein  36.56 
 
 
117 aa  61.6  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2777  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.29 
 
 
113 aa  61.6  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0722963  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2471  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.29 
 
 
113 aa  61.6  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.285762  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3899  cyclic nucleotide-binding protein  28.44 
 
 
113 aa  61.6  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2016  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 
116 aa  61.2  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178864  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.29 
 
 
110 aa  60.5  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.364082  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.29 
 
 
110 aa  60.5  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0691  hypothetical protein  33.68 
 
 
137 aa  59.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0788  cupin 2 domain-containing protein  31.52 
 
 
111 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.490865  normal  0.22734 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09790  cupin domain-containing protein  31.82 
 
 
219 aa  51.2  0.000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000778128 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08250  cupin domain-containing protein  28.43 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0145374  normal  0.40746 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0259  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.11 
 
 
104 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.72 
 
 
111 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.443195 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0891  cupin 2, barrel  29.27 
 
 
109 aa  47  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.049809  normal  0.341782 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1200  cupin 2, barrel  29.07 
 
 
115 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1508  Rhodanese domain protein  25 
 
 
207 aa  45.4  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5777  hypothetical protein  32.94 
 
 
111 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0517  cupin 2 domain-containing protein  35.06 
 
 
109 aa  45.1  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0622754 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0903  cupin 2 domain-containing protein  34.94 
 
 
120 aa  44.3  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.730716 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1897  cupin region  32.43 
 
 
110 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.766925  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5772  hypothetical protein  31.33 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86031  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3670  cupin 2 domain-containing protein  29.27 
 
 
111 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0801583 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4464  hypothetical protein  26.92 
 
 
106 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.289579  normal  0.0112764 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6124  transcriptional regulator, AraC family  27.78 
 
 
278 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0754  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.33 
 
 
131 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.88 
 
 
181 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0816  cupin 2 domain-containing protein  28.92 
 
 
106 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3737  cupin 2 domain-containing protein  40.38 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107824  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1894  hypothetical protein  26.61 
 
 
170 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2191  cupin region  32.76 
 
 
122 aa  40.8  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.357832  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1257  hypothetical protein  25.71 
 
 
125 aa  40.4  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2863  cupin 2, barrel  36.36 
 
 
107 aa  40.4  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>