81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0411 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 110 aa  222  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.364082  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 110 aa  222  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0346  cupin 2 domain-containing protein  70.91 
 
 		 110 aa  167  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000144683  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0224  hypothetical protein  69.31 
 
 		 110 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2801  cupin 2 domain-containing protein  67.65 
 
 		 105 aa  150  8e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.125759  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  64.55 
 
 		 110 aa  149  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0691  hypothetical protein  67.65 
 
 		 137 aa  147  5e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1985  hypothetical protein  58.18 
 
 		 111 aa  132  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000280772  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2019  cupin region  63.54 
 
 		 114 aa  131  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.935126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2934  cupin 2 domain-containing protein  64 
 
 		 111 aa  130  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1205  cupin 2 domain-containing protein  56.36 
 
 		 111 aa  130  5e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.710336  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0854  hypothetical protein  59.18 
 
 		 107 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  59.41 
 
 		 111 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.519233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0006  hypothetical protein  57.8 
 
 		 109 aa  122  1e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1966  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54 
 
 		 110 aa  119  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.290809  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0788  cupin 2 domain-containing protein  60.78 
 
 		 111 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.490865  normal  0.22734 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0699  hypothetical protein  51.4 
 
 		 121 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0351  cupin 2 domain-containing protein  53.15 
 
 		 111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0323  hypothetical protein  59.55 
 
 		 109 aa  114  3.9999999999999997e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2188  cupin 2, barrel  48.6 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00753726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0538  cupin 2, barrel  50.5 
 
 		 111 aa  111  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.426321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1633  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.66 
 
 		 121 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0994  hypothetical protein  53.12 
 
 		 117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1128  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.57 
 
 		 111 aa  104  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00311434  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2016  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.34 
 
 		 116 aa  99.4  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178864  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3898  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.24 
 
 		 113 aa  92.8  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1718  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.83 
 
 		 112 aa  90.1  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1645  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.83 
 
 		 112 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125951  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50.57 
 
 		 113 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0782  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.67 
 
 		 115 aa  87.8  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0960825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2229  cupin domain-containing protein  42.2 
 
 		 115 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.688365  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2828  cupin 2 domain-containing protein  41.28 
 
 		 124 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1603  cupin 2 domain-containing protein  50.6 
 
 		 87 aa  84.3  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.664487  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2471  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.24 
 
 		 113 aa  79  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.285762  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2777  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.24 
 
 		 113 aa  79  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0722963  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1552  cupin 2 domain-containing protein  41.05 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0359  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.35 
 
 		 118 aa  75.9  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09790  cupin domain-containing protein  40.4 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000778128 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0944  cupin 2 domain-containing protein  32.99 
 
 		 219 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0495  5'-nucleotidase SurE  32.99 
 
 		 214 aa  73.9  0.0000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0802  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.42 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0903  cupin 2 domain-containing protein  35.29 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730716 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08250  cupin domain-containing protein  32.58 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0145374  normal  0.40746 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0914  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.29 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3606  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.637892  normal  0.27033 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4464  hypothetical protein  29.9 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.289579  normal  0.0112764 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0816  cupin 2 domain-containing protein  29.9 
 
 		 106 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1897  cupin region  34.72 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.766925  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0259  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.37 
 
 		 104 aa  50.4  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4552  cupin region  27.59 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2191  cupin region  33.33 
 
 		 122 aa  48.9  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.357832  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1457  hypothetical protein  34.78 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5186  hypothetical protein  38.57 
 
 		 312 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.41986  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0275  hypothetical protein  39.71 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2268  cupin 2 domain-containing protein  33.9 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3899  cyclic nucleotide-binding protein  27.78 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3718  cupin 2, barrel  31.25 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.275117 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4488  hypothetical protein  34.72 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4856  cupin 2 domain-containing protein  32.35 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0262  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.94 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4575  hypothetical protein  34.72 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.131851 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4871  hypothetical protein  34.72 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468339  normal  0.0822888 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0235  hypothetical protein  33.82 
 
 		 127 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402341 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3333  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.59 
 
 		 294 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0663795  normal  0.136427 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1005  cupin 2 domain-containing protein  24.71 
 
 		 114 aa  42  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3113  cupin 2 domain-containing protein  39.29 
 
 		 174 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.487782  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12638  hypothetical protein  33.8 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0484137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.09 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.443195 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5772  hypothetical protein  28.99 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7093  hypothetical protein  38.64 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0681  hypothetical protein  33.93 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0517  cupin 2 domain-containing protein  27.63 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622754 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3670  cupin 2 domain-containing protein  26.15 
 
 		 111 aa  40.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801583 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4358  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.43 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.437014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1661  hypothetical protein  35.71 
 
 		 110 aa  40.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1738  cupin 2, barrel  25.81 
 
 		 112 aa  40  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.39391  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5777  hypothetical protein  23.46 
 
 		 111 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1699  hypothetical protein  28.41 
 
 		 111 aa  40  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275263  normal  0.0722973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2501  cupin 2 domain-containing protein  33.82 
 
 		 135 aa  40  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.342935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3553  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 111 aa  40  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.31919 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>