57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4552 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4552  cupin region  100 
 
 		 124 aa  254  4e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2828  cupin 2 domain-containing protein  29.06 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0538  cupin 2, barrel  35.42 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.426321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3606  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.637892  normal  0.27033 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2019  cupin region  35.48 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.935126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4464  hypothetical protein  31 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.289579  normal  0.0112764 
 
 
-
 
NC_002950  PG0323  hypothetical protein  32.71 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2471  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.41 
 
 		 113 aa  62  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.285762  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2777  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.41 
 
 		 113 aa  62  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0722963  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0816  cupin 2 domain-containing protein  30 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1966  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.63 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.290809  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2934  cupin 2 domain-containing protein  27.1 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0691  hypothetical protein  30.77 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0699  hypothetical protein  26.13 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.25 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1633  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.17 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0259  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.14 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.58 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1718  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.97 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0854  hypothetical protein  27.27 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1645  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.97 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125951  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0351  cupin 2 domain-containing protein  26.04 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0788  cupin 2 domain-containing protein  29.17 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.490865  normal  0.22734 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2801  cupin 2 domain-containing protein  28.42 
 
 		 105 aa  53.5  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.125759  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2229  cupin domain-containing protein  30.85 
 
 		 115 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.688365  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0994  hypothetical protein  31.71 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1552  cupin 2 domain-containing protein  31.25 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0782  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.96 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0960825  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0224  hypothetical protein  25.71 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0359  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.17 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1985  hypothetical protein  28.42 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000280772  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25 
 
 		 111 aa  51.6  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.519233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1128  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.55 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00311434  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0903  cupin 2 domain-containing protein  34.15 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730716 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.59 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.364082  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2016  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.52 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178864  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.59 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1205  cupin 2 domain-containing protein  26.26 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.710336  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2188  cupin 2, barrel  26.21 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00753726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0346  cupin 2 domain-containing protein  24.72 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000144683  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0802  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.59 
 
 		 112 aa  46.2  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0495  5'-nucleotidase SurE  22.55 
 
 		 214 aa  45.1  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0006  hypothetical protein  25.24 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4358  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.97 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.437014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2287  Cupin 2 conserved barrel domain protein  21.36 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.709012  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  35.56 
 
 		 123 aa  42.7  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1603  cupin 2 domain-containing protein  27.5 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.664487  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0927  cupin 2 domain-containing protein  32.86 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474041  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09790  cupin domain-containing protein  27 
 
 		 219 aa  42.7  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000778128 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  28.09 
 
 		 277 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0564  hypothetical protein  30.21 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2906  hypothetical protein  27.37 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.808157  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08250  cupin domain-containing protein  25.61 
 
 		 113 aa  42  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0145374  normal  0.40746 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3596  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 301 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000994716  hitchhiker  0.0000611237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5062  hypothetical protein  35.94 
 
 		 157 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0944  cupin 2 domain-containing protein  21.57 
 
 		 219 aa  41.2  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4174  hypothetical protein  27.27 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.257816  normal  0.271179 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>