75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1718 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1718  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 112 aa  224  4e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1645  Cupin 2 conserved barrel domain protein  98.21 
 
 		 112 aa  221  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125951  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2229  cupin domain-containing protein  91.89 
 
 		 115 aa  207  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.688365  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2828  cupin 2 domain-containing protein  82.14 
 
 		 124 aa  189  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2777  Cupin 2 conserved barrel domain protein  63.64 
 
 		 113 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0722963  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2471  Cupin 2 conserved barrel domain protein  62.73 
 
 		 113 aa  135  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.285762  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2801  cupin 2 domain-containing protein  51.61 
 
 		 105 aa  103  9e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.125759  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2934  cupin 2 domain-containing protein  55.06 
 
 		 111 aa  103  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50 
 
 		 111 aa  102  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.519233  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0323  hypothetical protein  51.69 
 
 		 109 aa  99.4  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2019  cupin region  50.54 
 
 		 114 aa  98.6  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.935126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0994  hypothetical protein  48.54 
 
 		 117 aa  97.8  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0346  cupin 2 domain-containing protein  51.09 
 
 		 110 aa  97.8  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000144683  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0224  hypothetical protein  48.39 
 
 		 110 aa  93.2  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0006  hypothetical protein  46.81 
 
 		 109 aa  92.4  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0691  hypothetical protein  47.31 
 
 		 137 aa  92  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1205  cupin 2 domain-containing protein  40.21 
 
 		 111 aa  91.3  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.710336  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1633  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.3 
 
 		 121 aa  90.5  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.83 
 
 		 110 aa  90.1  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50.56 
 
 		 110 aa  90.1  9e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.83 
 
 		 110 aa  90.1  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.364082  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0351  cupin 2 domain-containing protein  40.19 
 
 		 111 aa  88.2  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0854  hypothetical protein  40.62 
 
 		 107 aa  87.4  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0699  hypothetical protein  36.56 
 
 		 121 aa  87  7e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0538  cupin 2, barrel  36.11 
 
 		 111 aa  86.3  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.426321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0788  cupin 2 domain-containing protein  42.55 
 
 		 111 aa  84  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.490865  normal  0.22734 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1985  hypothetical protein  37.62 
 
 		 111 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000280772  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2188  cupin 2, barrel  37.5 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00753726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2016  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.39 
 
 		 116 aa  79  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178864  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1966  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.94 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.290809  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1128  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.56 
 
 		 111 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00311434  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.68 
 
 		 113 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1603  cupin 2 domain-containing protein  44.58 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.664487  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0944  cupin 2 domain-containing protein  33.63 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0782  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.46 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0960825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3606  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.62 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.637892  normal  0.27033 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0914  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 		 112 aa  67  0.00000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3898  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.96 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0495  5'-nucleotidase SurE  29.91 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0259  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.67 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4464  hypothetical protein  35.63 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.289579  normal  0.0112764 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0816  cupin 2 domain-containing protein  34.48 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09790  cupin domain-containing protein  33.64 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000778128 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1552  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 112 aa  57  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08250  cupin domain-containing protein  40.58 
 
 		 113 aa  57  0.00000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0145374  normal  0.40746 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0359  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.63 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4552  cupin region  28.97 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0903  cupin 2 domain-containing protein  36.78 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730716 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0802  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.77 
 
 		 112 aa  49.7  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1690  hypothetical protein  32.86 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0136157 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1897  cupin region  27.27 
 
 		 110 aa  47  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.766925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3553  cupin 2 domain-containing protein  32 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3899  cyclic nucleotide-binding protein  25.26 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5708  cupin 2 domain-containing protein  31.71 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.203885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2831  cupin 2 domain-containing protein  30 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2268  cupin 2 domain-containing protein  28.75 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1207  cupin 2 domain-containing protein  27.27 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0439  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.5 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.395009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0425  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.75 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0839073  hitchhiker  0.0000787974 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2885  AraC family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 299 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.17 
 
 		 113 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12638  hypothetical protein  35.71 
 
 		 117 aa  41.2  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0484137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2869  hypothetical protein  23.6 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175305  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3665  hypothetical protein  28.57 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0265322 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0365  AraC family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 261 aa  40.8  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0791032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1417  AraC family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 261 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17982  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.17 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6281  hypothetical protein  36.59 
 
 		 149 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1863  cupin 2 domain-containing protein  30.86 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.524548 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1526  AraC family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 261 aa  40.4  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7093  hypothetical protein  29.69 
 
 		 89 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4358  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.29 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.437014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1738  cupin 2, barrel  25.84 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.39391  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1661  hypothetical protein  36.62 
 
 		 110 aa  40  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>