32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1207 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1207  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 112 aa  228  2e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1738  cupin 2, barrel  75.89 
 
 		 112 aa  174  3e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.39391  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2869  hypothetical protein  62.5 
 
 		 112 aa  149  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175305  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3665  hypothetical protein  59.46 
 
 		 112 aa  144  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0265322 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1690  hypothetical protein  56.44 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0136157 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1054  cupin family protein  55.88 
 
 		 104 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1897  cupin region  42.86 
 
 		 110 aa  89.4  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.766925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2191  cupin region  34.62 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.357832  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2799  hypothetical protein  34.31 
 
 		 104 aa  60.1  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.7832900000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08490  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.07 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.09 
 
 		 110 aa  47.4  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0602  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.88 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2471  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.25 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.285762  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2777  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.25 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0722963  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5012  hypothetical protein  31.25 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120588  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1158  XRE family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 179 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000119717  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1180  helix-turn-helix domain-containing protein  30.95 
 
 		 179 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0994  hypothetical protein  27.17 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2863  cupin 2, barrel  27.36 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0685  Cro/CI family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1718  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.27 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0346  cupin 2 domain-containing protein  27.06 
 
 		 110 aa  41.6  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000144683  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1645  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.27 
 
 		 112 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125951  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4417  cupin:cupin region  26.13 
 
 		 155 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1387  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  32.86 
 
 		 249 aa  41.6  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00099914  normal  0.234758 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2828  cupin 2 domain-containing protein  25 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0351  cupin 2 domain-containing protein  25.33 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0006  hypothetical protein  32.94 
 
 		 109 aa  40.4  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0400  cupin 2 domain-containing protein  36.49 
 
 		 129 aa  40.8  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01320  hypothetical protein  30.95 
 
 		 122 aa  40.4  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.333196  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2157  cupin 2, barrel  35.06 
 
 		 147 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0974853 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0204  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 160 aa  40  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>