34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2799 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2799  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  212  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.7832900000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2869  hypothetical protein  38.64 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175305  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1054  cupin family protein  37.25 
 
 		 104 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1690  hypothetical protein  39.6 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0136157 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3665  hypothetical protein  32.67 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0265322 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1207  cupin 2 domain-containing protein  34.31 
 
 		 112 aa  60.1  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1738  cupin 2, barrel  36.9 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.39391  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.71 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1897  cupin region  28.43 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.766925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08490  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2191  cupin region  43.14 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.357832  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4297  cupin 2 domain-containing protein  29.41 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.47 
 
 		 166 aa  47  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 		 192 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2610  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 199 aa  47  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  33.72 
 
 		 190 aa  46.2  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1041  cupin 2 domain-containing protein  33.85 
 
 		 311 aa  45.4  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421449  normal  0.0580221 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1662  cupin 2 domain-containing protein  29.63 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000140317  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1707  cupin 2 protein  35.59 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5084  cupin superfamily protein  30.68 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0259637  normal  0.536671 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.7 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1023  cupin 2 domain-containing protein  29.23 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4525  cupin 2 domain-containing protein  31.71 
 
 		 147 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1608  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.92 
 
 		 104 aa  41.6  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104789  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.89 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2934  cupin 2 domain-containing protein  28.99 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0969  hypothetical protein  31.71 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.307514  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1439  cupin 2 domain-containing protein  30.91 
 
 		 199 aa  40.8  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.83171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.85 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.625862  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.23 
 
 		 122 aa  40.8  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438384  normal  0.13585 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0262  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.54 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5450  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.11 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2249  cupin 2, barrel  28.57 
 
 		 143 aa  40.4  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  38.78 
 
 		 150 aa  40  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>