33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1439 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1439  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 199 aa  395  1e-109  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.83171  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2610  Cupin 2 conserved barrel domain protein  64.8 
 
 		 199 aa  270  8.000000000000001e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2287  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.13 
 
 		 125 aa  85.1  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.709012  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1972  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.38 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.57 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1549  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.05 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0956  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.56 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1973  hypothetical protein  36.99 
 
 		 77 aa  53.1  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.768292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0032  hypothetical protein  42.47 
 
 		 98 aa  53.9  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0241551  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0137  hypothetical protein  36.11 
 
 		 98 aa  53.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00160252  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2191  cupin region  31.25 
 
 		 122 aa  50.1  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.357832  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 146 aa  48.1  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1236  hypothetical protein  34.72 
 
 		 85 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000489654  unclonable  0.0000000165083 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1897  cupin region  24.56 
 
 		 110 aa  47.8  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.766925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1550  hypothetical protein  33.77 
 
 		 77 aa  47  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4862  hypothetical protein  22.73 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.902851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2863  cupin 2, barrel  33.78 
 
 		 107 aa  45.4  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08490  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.28 
 
 		 105 aa  44.7  0.0009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1474  hypothetical protein  29.58 
 
 		 89 aa  44.7  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0782723 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0469  hypothetical protein  33.77 
 
 		 75 aa  44.3  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000487548  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3790  hypothetical protein  25 
 
 		 82 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.142548 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3665  hypothetical protein  36 
 
 		 112 aa  43.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0265322 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1674  hypothetical protein  26.76 
 
 		 82 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.477386  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1298  cupin 2 domain-containing protein  32.94 
 
 		 127 aa  42.4  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0121  hypothetical protein  31.51 
 
 		 80 aa  42.4  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000914401  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1738  cupin 2, barrel  31.33 
 
 		 112 aa  42  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.39391  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1764  Protein of unknown function DUF2249  32.43 
 
 		 77 aa  42  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2869  hypothetical protein  25.56 
 
 		 112 aa  41.6  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175305  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.48 
 
 		 123 aa  41.6  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2906  hypothetical protein  36.36 
 
 		 106 aa  41.6  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.808157  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5785  protein of unknown function DUF542 ScdA domain protein  30.11 
 
 		 312 aa  41.6  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4036  hypothetical protein  25.35 
 
 		 83 aa  41.6  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3850  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.48 
 
 		 131 aa  41.2  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>