18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1549 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1549  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 144 aa  285  1e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1972  Cupin 2 conserved barrel domain protein  67.19 
 
 		 143 aa  173  7e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  72.13 
 
 		 124 aa  157  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2287  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.47 
 
 		 125 aa  87.4  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.709012  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1439  cupin 2 domain-containing protein  39.05 
 
 		 199 aa  77.4  0.00000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.83171  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2610  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.45 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2906  hypothetical protein  27.27 
 
 		 106 aa  49.7  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.808157  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2303  hypothetical protein  34.44 
 
 		 109 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000111298  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2869  hypothetical protein  27 
 
 		 112 aa  45.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175305  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.33 
 
 		 172 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0564  hypothetical protein  25.25 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1033  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.51 
 
 		 172 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.714129  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0857  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.24 
 
 		 105 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.155905 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0971  cupin domain-containing protein  29.51 
 
 		 171 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.341283  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6135  hypothetical protein  38.33 
 
 		 155 aa  41.6  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.715074  normal  0.381762 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2863  cupin 2, barrel  32.63 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0737  cupin 2 domain-containing protein  44 
 
 		 207 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0847  cupin 2 domain-containing protein  32.93 
 
 		 153 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0541373 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>