19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2303 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2303  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  219  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000111298  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0857  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60 
 
 		 105 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.155905 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2382  Cupin 2 conserved barrel domain protein  64.71 
 
 		 104 aa  114  6e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1821  cupin 2 domain-containing protein  50 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.550479 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1164  Cupin 2 conserved barrel domain protein  52.75 
 
 		 106 aa  97.8  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0344247  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2287  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.67 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.709012  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1972  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.69 
 
 		 143 aa  51.2  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1317  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.7 
 
 		 112 aa  47  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0994  hypothetical protein  31.31 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0782  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0960825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0538  cupin 2, barrel  30.93 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.426321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3544  cysteine dioxygenase type I  32.86 
 
 		 224 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.272534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1128  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.74 
 
 		 111 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00311434  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3670  cupin 2 domain-containing protein  31.65 
 
 		 111 aa  41.6  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801583 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0564  hypothetical protein  28.26 
 
 		 106 aa  41.6  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1552  cupin 2 domain-containing protein  27.62 
 
 		 112 aa  41.2  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0432  cupin region  33.8 
 
 		 117 aa  40.4  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.583729  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3039  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.44 
 
 		 112 aa  40  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.124018 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2863  cupin 2, barrel  29.91 
 
 		 107 aa  40  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>