34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1317 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1317  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 112 aa  227  4e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1821  cupin 2 domain-containing protein  30.1 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.550479 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0564  hypothetical protein  34.07 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2287  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.04 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.709012  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2906  hypothetical protein  34.44 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.808157  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2863  cupin 2, barrel  31.96 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2019  cupin region  29.27 
 
 		 114 aa  47.4  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.935126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2303  hypothetical protein  28.7 
 
 		 109 aa  47  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000111298  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0538  cupin 2, barrel  32.5 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.426321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2382  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.73 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1985  hypothetical protein  30.86 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000280772  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0857  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.11 
 
 		 105 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.155905 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1128  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.38 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00311434  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1633  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.93 
 
 		 121 aa  43.5  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2191  cupin region  28.92 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.357832  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1054  cupin family protein  36.21 
 
 		 104 aa  42.7  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1966  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.3 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.290809  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0782  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.19 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0960825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1552  cupin 2 domain-containing protein  31.18 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3553  cupin 2 domain-containing protein  35.21 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0944  cupin 2 domain-containing protein  24.44 
 
 		 219 aa  42.4  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1603  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.664487  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1205  cupin 2 domain-containing protein  26.25 
 
 		 111 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.710336  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.07 
 
 		 117 aa  41.6  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.588155  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1033  hypothetical protein  28.89 
 
 		 112 aa  42  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.92 
 
 		 113 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0903  cupin 2 domain-containing protein  24.74 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730716 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.519233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0571  pectin degradation protein kdgF  29.49 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0346  cupin 2 domain-containing protein  26.83 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000144683  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1164  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.53 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0344247  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2869  hypothetical protein  31.76 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175305  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2453  cupin domain-containing protein  30.77 
 
 		 137 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2589  pectin degradation protein KdgF  30.77 
 
 		 137 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>