14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2382 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2382  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 104 aa  213  5e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0857  Cupin 2 conserved barrel domain protein  70.59 
 
 		 105 aa  130  9e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.155905 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1164  Cupin 2 conserved barrel domain protein  65.91 
 
 		 106 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0344247  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2303  hypothetical protein  64.71 
 
 		 109 aa  114  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000111298  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1821  cupin 2 domain-containing protein  56.47 
 
 		 134 aa  111  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.550479 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0361  hypothetical protein  30.93 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.642928  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5772  hypothetical protein  30.93 
 
 		 111 aa  47  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.96 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.443195 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1317  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.73 
 
 		 112 aa  44.7  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2863  cupin 2, barrel  36.84 
 
 		 107 aa  41.2  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0982  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0897  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.56 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2588  cupin region  26.26 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.362535 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>