21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2588 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2588  cupin region  100 
 
 		 123 aa  255  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.362535 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3512  Cupin 2 conserved barrel domain protein  57.39 
 
 		 126 aa  143  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2605  Cupin 2 conserved barrel domain protein  57.39 
 
 		 126 aa  143  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0523242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2150  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.13 
 
 		 118 aa  106  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.491101  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1481  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.9 
 
 		 118 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000853515 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1856  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.9 
 
 		 118 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0185849  hitchhiker  0.0000000000536602 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6339  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  46.9 
 
 		 160 aa  100  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399971  hitchhiker  0.000000968106 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4483  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.9 
 
 		 160 aa  100  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000935764 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.71 
 
 		 117 aa  67  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.588155  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0564  hypothetical protein  35.11 
 
 		 106 aa  50.4  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3060  cupin domain protein  30.56 
 
 		 197 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2906  hypothetical protein  34.04 
 
 		 106 aa  50.4  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.808157  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00420  cupin domain-containing protein  24.55 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.33037 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2863  cupin 2, barrel  29.47 
 
 		 107 aa  47  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  31.87 
 
 		 163 aa  43.9  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4274  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.17 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.8 
 
 		 146 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1599  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.78 
 
 		 108 aa  41.2  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00522565 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2382  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.26 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0206  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.56 
 
 		 115 aa  40.4  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2162  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.43 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000761945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>