107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2453 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0889  hypothetical protein  98.54 
 
 		 169 aa  283  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2453  cupin domain-containing protein  100 
 
 		 137 aa  283  7e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2589  pectin degradation protein KdgF  99.27 
 
 		 137 aa  282  9e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933509  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0571  pectin degradation protein kdgF  92.62 
 
 		 138 aa  242  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.71 
 
 		 113 aa  90.9  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1368  hypothetical protein  39.05 
 
 		 116 aa  87  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.505892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1863  cupin 2 domain-containing protein  44.33 
 
 		 100 aa  85.9  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.524548 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1005  cupin 2 domain-containing protein  39.8 
 
 		 114 aa  84.7  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1396  cupin 2 domain-containing protein  38.78 
 
 		 102 aa  79.7  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0865  cupin 2 domain-containing protein  36.79 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2655  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  43.02 
 
 		 114 aa  74.7  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.104374  hitchhiker  0.00638268 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0780  cupin 2 domain-containing protein  37.96 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000921  putative pectin degradation protein  36.27 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2538  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.68 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0103935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2408  cupin 2 domain-containing protein  38.71 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.231406 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0274  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  41.94 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2268  cupin 2 domain-containing protein  37.36 
 
 		 111 aa  63.5  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1623  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.36 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0731  cupin 2 domain-containing protein  36.96 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00910188  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3553  cupin 2 domain-containing protein  36.52 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0257  cupin 2 domain-containing protein  32.32 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2135  cupin 2 domain-containing protein  36.56 
 
 		 100 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.769565  normal  0.829686 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1482  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.73 
 
 		 94 aa  61.6  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.336107  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2699  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.31 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145082  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0483  hypothetical protein  36.56 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.654168  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3287  cupin 2 domain-containing protein  37.38 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.927122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3228  mannose-6-phosphate isomerase  34.26 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0483  cupin 2 domain-containing protein  34.52 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3966  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0837  cupin 2 domain-containing protein  34.26 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168826 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3283  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.73 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.219448 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3856  cupin 2, barrel  30.48 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.875667 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1659  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.84 
 
 		 108 aa  57  0.00000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0833  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.63 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3323  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.56 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00344723  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2840  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.97 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.862394  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1168  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.78 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0230076  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1026  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.09 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.208422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3670  cupin 2 domain-containing protein  32.98 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183912  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3893  pectin degradation protein  35.48 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11503  putative pectin degradation protein  26.36 
 
 		 130 aa  53.5  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.380023  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2041  cupin 2 domain-containing protein  32.32 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267736 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3463  cupin 2, barrel  32.11 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0506  hypothetical protein  29.52 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0871689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3290  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.84 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7186  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.26 
 
 		 109 aa  52  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.53 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8499800000000002e-33 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3473  cupin 2 domain-containing protein  37.29 
 
 		 162 aa  50.1  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.017049  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5003  cupin 2 domain-containing protein  31.88 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.83 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3115  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.59 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.768633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3387  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.59 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal  0.219685 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2189  cupin 2 domain-containing protein  26.85 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.525757  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3039  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.15 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.124018 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6850  cupin 2 domain-containing protein  28.87 
 
 		 105 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1190  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.03 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4742  cupin 2 domain-containing protein  31.11 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000930389 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5111  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.08 
 
 		 167 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4209  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.28 
 
 		 166 aa  47.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.73 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3615  cupin 2 domain-containing protein  35.21 
 
 		 136 aa  47  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0243585  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0220  hypothetical protein  35.59 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3018  cupin 2 domain-containing protein  29.73 
 
 		 165 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.609339  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4192  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.93 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  hitchhiker  0.00969198 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1504  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.88 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0906  cupin region  30.99 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.168616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3105  cupin 2 domain-containing protein  25.69 
 
 		 115 aa  45.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2202  hypothetical protein  30.43 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4894  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 177 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3716  cupin 2, barrel  34.92 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000701811  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4895  cupin 2 domain-containing protein  29.07 
 
 		 167 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.664893 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4843  cupin 2 domain-containing protein  30.43 
 
 		 182 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.45501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1354  cupin 2, barrel  31.58 
 
 		 169 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.688932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0792  hypothetical protein  31.88 
 
 		 170 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2368  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.034272  normal  0.382558 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3173  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.88 
 
 		 171 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457718 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0542  cupin 2, barrel  32.35 
 
 		 122 aa  44.7  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0847  cupin 2 domain-containing protein  32.41 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0560  cupin 2 domain-containing protein  31.88 
 
 		 161 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172519  hitchhiker  0.000823195 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1493  cupin:cupin region  34.21 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0829  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.21 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.55618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.41 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1911  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.57 
 
 		 131 aa  43.9  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.997303  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1173  cupin 2 domain-containing protein  31.88 
 
 		 180 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0388903  normal  0.0358477 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1333  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.88 
 
 		 180 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.861025  normal  0.798178 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1980  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.67 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3657  cupin 2, barrel  29.58 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4554  cupin 2 domain-containing protein  33.8 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0071761 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5069  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.39 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3294  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.21 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53927  normal  0.0737316 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.18 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  34.48 
 
 		 133 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3737  cupin 2 domain-containing protein  35.82 
 
 		 135 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107824  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4006  cupin 2 domain-containing protein  32.26 
 
 		 137 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0681  hypothetical protein  30.77 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1849  transcriptional regulator, AraC family  35.94 
 
 		 280 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1696  cupin domain-containing protein  31.13 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>