26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1054 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1054  cupin family protein  100 
 
 
104 aa  206  1e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3665  hypothetical protein  62.38 
 
 
112 aa  133  9e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0265322 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1207  cupin 2 domain-containing protein  55.88 
 
 
112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1690  hypothetical protein  53.54 
 
 
118 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0136157 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2869  hypothetical protein  52.94 
 
 
112 aa  111  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175305  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1738  cupin 2, barrel  50 
 
 
112 aa  105  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.39391  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1897  cupin region  35.29 
 
 
110 aa  77.8  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.766925  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2191  cupin region  36.27 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.357832  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2799  hypothetical protein  37.25 
 
 
104 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.7832900000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08490  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.73 
 
 
105 aa  60.5  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.03 
 
 
128 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0602  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.84 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2934  cupin 2 domain-containing protein  26.44 
 
 
111 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1317  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.21 
 
 
112 aa  42.7  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2863  cupin 2, barrel  30.38 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2471  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.55 
 
 
113 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.285762  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2777  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.55 
 
 
113 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0722963  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4417  cupin:cupin region  28.57 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2600  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.81 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.556264 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3618  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.48 
 
 
153 aa  41.6  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.471134  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0346  cupin 2 domain-containing protein  27.27 
 
 
110 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000144683  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4359  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.75 
 
 
114 aa  41.2  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0347  Mannose-1-phosphate guanylyltransferase  31.65 
 
 
476 aa  40.8  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5012  hypothetical protein  27.66 
 
 
155 aa  40.4  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120588  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1662  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 
108 aa  40.4  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000140317  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3670  cupin 2 domain-containing protein  28.79 
 
 
111 aa  40.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0801583 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>