125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1662 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1662  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 108 aa  220  4e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000140317  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1608  Cupin 2 conserved barrel domain protein  88.24 
 
 		 104 aa  186  8e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104789  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2863  cupin 2, barrel  30.61 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3746  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4317  polyketide synthesis domain protein  32.43 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4469  polyketide synthesis domain-containing protein  32.43 
 
 		 116 aa  52  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.51 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1897  cupin region  34.67 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.766925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003224  mannose-6-phosphate isomerase  32.18 
 
 		 116 aa  51.2  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4399  polyketide synthesis domain protein  31.08 
 
 		 116 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4402  polyketide synthesis domain-containing protein  31.08 
 
 		 116 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.155389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4287  polyketide synthesis domain protein  31.08 
 
 		 116 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.640485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4417  cupin:cupin region  37.7 
 
 		 155 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3018  cupin domain-containing protein  33.78 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.117139  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3858  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.38 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  31.58 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2775  cupin 2 domain-containing protein  33.78 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.108544  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2982  polyketide synthesis domain protein  33.78 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2260  polyketide synthesis domain protein  33.78 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0666056 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2610  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 199 aa  49.3  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2770  cupin domain-containing protein  33.78 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2719  hypothetical protein  33.78 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2699  hypothetical protein  29.7 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.615203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2981  cupin domain-containing protein  33.78 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 		 192 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3020  polyketide synthesis domain protein  33.78 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2978  polyketide synthesis domain protein  33.78 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000628046 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2191  cupin region  34.94 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.357832  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0206  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.38 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1488  cupin 2 domain-containing protein  32.81 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00804045  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  34.57 
 
 		 172 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0468  cupin 2 domain-containing protein  32.88 
 
 		 361 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1601  cupin 2 domain-containing protein  32.88 
 
 		 361 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0589  cupin 2 domain-containing protein  32.88 
 
 		 361 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5012  hypothetical protein  37.1 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120588  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0677  cupin 2 domain-containing protein  32.88 
 
 		 255 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1759  hypothetical protein  24.21 
 
 		 124 aa  47.4  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.38 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2072  auxin-binding protein, putative  31 
 
 		 167 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0382674  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1816  cupin 2 domain-containing protein  29.58 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.337557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1532  cupin 2 domain-containing protein  31.82 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1628  cupin 2, barrel  31.51 
 
 		 356 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1654  cupin 2 domain-containing protein  31.51 
 
 		 361 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5102  gentisate 1,2-dioxygenase  35.71 
 
 		 283 aa  45.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.562854 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2228  cupin 2 domain-containing protein  29.9 
 
 		 166 aa  45.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300974 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.84 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2919  hypothetical protein  32.84 
 
 		 114 aa  45.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000876891  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2799  hypothetical protein  29.63 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.7832900000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0266  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.99 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.465169  normal  0.12222 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  38.6 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5250  cupin 2 domain-containing protein  28.75 
 
 		 373 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.665578 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1882  auxin-binding protein, putative  31 
 
 		 167 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5450  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.91 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5545  cupin 2 domain-containing protein  31.75 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4562  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.43 
 
 		 153 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10448  hypothetical protein  38.67 
 
 		 179 aa  43.9  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1915  cupin 2 domain-containing protein  35.59 
 
 		 129 aa  43.5  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1371  cupin 2 domain-containing protein  27.94 
 
 		 372 aa  43.9  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898845 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2675  cupin 2 domain-containing protein  35.71 
 
 		 343 aa  43.5  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4857  cupin domain-containing protein  27.72 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0286871 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2100  cupin region  37.88 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3113  cupin 2 domain-containing protein  31.67 
 
 		 174 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.487782  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2476  cupin 2 domain-containing protein  31.88 
 
 		 334 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2162  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.51 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  39.62 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3499  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.04 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.163476 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0544  hypothetical protein, putative phage gene  28.74 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.597495  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  29.23 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3175  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.04 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5802  gentisate 1,2-dioxygenase  30 
 
 		 364 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1579  TonB box-like  29.33 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.37 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  31.67 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0367  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose- 6-phosphate isomerase  29.23 
 
 		 486 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1331  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.83 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3249  cupin 2 domain-containing protein  30.38 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3867  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.23 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.468547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08490  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.27 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.55 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.82 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2254  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 370 aa  41.6  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1620  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 176 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36928  predicted protein  32.79 
 
 		 179 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1644  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.38 
 
 		 154 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.522674  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.07 
 
 		 149 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.74 
 
 		 152 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2200  hypothetical protein  30 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.192403 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2973  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30.16 
 
 		 274 aa  41.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1350  cupin 2 domain-containing protein  32.69 
 
 		 287 aa  41.2  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.832765  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2148  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.54 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0024464  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2813  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.23 
 
 		 350 aa  41.2  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.92 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2878  N-acetylneuraminic acid synthase domain protein  35.59 
 
 		 497 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.251215  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3034  gentisate 1,2-dioxygenase  32.91 
 
 		 370 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3304  signal peptide protein  32.98 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0282721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  27.94 
 
 		 163 aa  41.2  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  29.03 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3845  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 297 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.235864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.76 
 
 		 172 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.814089  normal  0.762073 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>