41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0544 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0544  hypothetical protein, putative phage gene  100 
 
 		 116 aa  238  2e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.597495  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003224  mannose-6-phosphate isomerase  82.76 
 
 		 116 aa  206  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1646  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.74 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1305  cupin 2, barrel  27.08 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0335072  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0206  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.18 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1532  cupin 2 domain-containing protein  29.59 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0788  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.39 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0570  methionine--tRNA ligase  37.1 
 
 		 659 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.755013 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0973  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.83 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0266  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.56 
 
 		 130 aa  47.4  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.465169  normal  0.12222 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2148  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.91 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0024464  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1488  cupin 2 domain-containing protein  27.55 
 
 		 115 aa  47  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00804045  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2394  cupin 2 domain-containing protein  35.71 
 
 		 151 aa  45.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00264239  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2286  cupin 2 domain-containing protein  25.58 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.47 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.14 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  26.56 
 
 		 148 aa  43.9  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2162  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.25 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  30.26 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1662  cupin 2 domain-containing protein  28.74 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000140317  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0545  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4274  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  31.4 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.21 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1882  auxin-binding protein, putative  32.88 
 
 		 167 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.34 
 
 		 140 aa  41.6  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5804  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.82 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2945  cupin 2 domain-containing protein  29.17 
 
 		 171 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2228  cupin 2 domain-containing protein  27.83 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300974 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2965  hypothetical protein  26.92 
 
 		 130 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0208057  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0347  Mannose-1-phosphate guanylyltransferase  36.59 
 
 		 476 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1644  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.99 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.522674  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2411  cupin 2 domain-containing protein  25.3 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.36 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3623  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.73 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2150  cupin 2 domain-containing protein  24.36 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0837605 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1904  cupin region  29.17 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.58 
 
 		 152 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4208  Methionine--tRNA ligase  29.11 
 
 		 645 aa  40.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0857223  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  27.17 
 
 		 123 aa  40  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  30.86 
 
 		 172 aa  40  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>