32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0788 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0788  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 
114 aa  233  7e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1305  cupin 2, barrel  49.54 
 
 
115 aa  102  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0335072  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1488  cupin 2 domain-containing protein  43.27 
 
 
115 aa  93.2  9e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00804045  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1532  cupin 2 domain-containing protein  42.31 
 
 
115 aa  90.5  6e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0973  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.6 
 
 
118 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0206  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.27 
 
 
115 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2162  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 
115 aa  63.2  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1646  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.19 
 
 
116 aa  62.4  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003224  mannose-6-phosphate isomerase  31.13 
 
 
116 aa  51.6  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0544  hypothetical protein, putative phage gene  30.39 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.597495  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5234  cupin 2 domain-containing protein  39.44 
 
 
172 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0933989  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2605  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.78 
 
 
126 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0523242  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3512  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.78 
 
 
126 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1468  cupin 2 domain-containing protein  38.71 
 
 
190 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0577  hypothetical protein  36.62 
 
 
125 aa  42.7  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.116523  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1044  methionine--tRNA ligase  36.92 
 
 
671 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0578  L-ectoine synthase  26.85 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2638  L-ectoine synthase  27.91 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.766502  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.35 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.754668  normal  0.233584 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4169  cupin 2 domain-containing protein  37.68 
 
 
155 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3346  cupin 2 domain-containing protein  37.68 
 
 
155 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4820  cupin 2, barrel  37.68 
 
 
155 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  30.68 
 
 
163 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2908  hypothetical protein  37.68 
 
 
155 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3140  mannose-6-phosphate isomerase, bifunctional enzyme  31.88 
 
 
458 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.116688  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2973  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.62 
 
 
274 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.78 
 
 
126 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.71 
 
 
163 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1685  cupin 2 domain-containing protein  33.9 
 
 
141 aa  40.4  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0801  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.67 
 
 
122 aa  40.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.332449  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5012  hypothetical protein  50 
 
 
155 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120588  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5131  cupin 2 domain-containing protein  38.57 
 
 
155 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720465  normal  0.658143 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>