167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6233 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 163 aa  324  4.0000000000000003e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.07 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  35.67 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6634  cupin 2 domain-containing protein  36.3 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.718615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0837  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.65 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3153  cupin 2 domain-containing protein  34.55 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5299  hypothetical protein  32 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2609  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  39.58 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5545  cupin 2 domain-containing protein  28.99 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0565  hypothetical protein  37.36 
 
 		 155 aa  62  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.52627 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.3 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.754668  normal  0.233584 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0604  cupin 2, barrel  33.68 
 
 		 165 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398371  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0617  cupin 2 domain-containing protein  33.68 
 
 		 165 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0595  cupin 2 domain-containing protein  33.68 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2309  hypothetical protein  32.08 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.5332  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2141  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.44 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1285  cupin region  33.33 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3707  cupin 2, barrel  28.69 
 
 		 138 aa  57  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.602346 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.65 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.51 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0144  cupin 2 domain-containing protein  32.63 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  30.99 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0483  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.58 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.319109  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.52 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  31.63 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  37.21 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 		 192 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  39.39 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  40.98 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  29.71 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0747  cupin-like protein  31.51 
 
 		 169 aa  52  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3405  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.37 
 
 		 156 aa  52  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0262  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.84 
 
 		 121 aa  50.8  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.04 
 
 		 159 aa  50.8  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2409  cupin family protein  37.1 
 
 		 114 aa  50.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116838  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  34.29 
 
 		 171 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.65 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  37.33 
 
 		 190 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.52 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4882  hypothetical protein  29.13 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.61 
 
 		 184 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3858  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.98 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3773  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.99 
 
 		 421 aa  48.9  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.239832  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35 
 
 		 138 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0760  cupin 2 domain-containing protein  28.42 
 
 		 178 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.519438 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.13 
 
 		 181 aa  48.9  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1827  hypothetical protein  28.33 
 
 		 121 aa  48.5  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4239  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.82 
 
 		 163 aa  48.5  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.637233  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3067  cupin 2 domain-containing protein  31.37 
 
 		 145 aa  48.5  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3197  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.33 
 
 		 191 aa  47.8  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229687  normal  0.39078 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0204  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.77 
 
 		 160 aa  47.4  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4562  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.09 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1305  cupin 2, barrel  40 
 
 		 115 aa  47  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0335072  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5660  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.67 
 
 		 170 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.215719 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3501  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.29 
 
 		 184 aa  47  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2364  mannose-6-phosphate isomerase  33.33 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.960914  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3782  hypothetical protein  34.21 
 
 		 142 aa  46.6  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000165271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.43 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2878  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  31.52 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.67 
 
 		 204 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3503  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.29 
 
 		 182 aa  45.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  30 
 
 		 137 aa  45.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.93 
 
 		 146 aa  45.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2831  cupin 2 domain-containing protein  39.47 
 
 		 117 aa  45.8  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1468  cupin 2 domain-containing protein  33.72 
 
 		 190 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1660  Mannose-6-phosphate isomerase  33.33 
 
 		 117 aa  45.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2471  mannose-6-phosphate isomerase, type II:cupin region  34.52 
 
 		 126 aa  45.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5012  hypothetical protein  38.46 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120588  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2891  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  36.05 
 
 		 479 aa  45.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.232299 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3293  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  36.05 
 
 		 479 aa  45.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.448941  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.67 
 
 		 204 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3273  methionyl-tRNA synthetase  29.52 
 
 		 662 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.433163 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1366  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  36.05 
 
 		 480 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.31 
 
 		 186 aa  44.7  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.399642  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2295  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.44 
 
 		 166 aa  44.7  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3787  homogentisate 12-dioxygenase  41.03 
 
 		 407 aa  45.1  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2161  cupin 2 domain-containing protein  26.72 
 
 		 152 aa  44.7  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0191913  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0119  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.09 
 
 		 195 aa  44.7  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.338448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  29.03 
 
 		 153 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1864  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.82 
 
 		 144 aa  44.3  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1774  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  37.97 
 
 		 475 aa  44.3  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0223  cupin 2 domain-containing protein  37.1 
 
 		 114 aa  44.3  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1447  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.93 
 
 		 190 aa  44.3  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.901222  normal  0.428247 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1355  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.38 
 
 		 195 aa  44.3  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.646374  normal  0.0330672 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1177  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.26 
 
 		 152 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1927  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  43.1 
 
 		 477 aa  43.9  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.328614  normal  0.35544 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0347  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  34.52 
 
 		 471 aa  43.5  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.953592  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04560  expressed protein  30.23 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0261  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  35.71 
 
 		 481 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000377748  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0456  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  31.63 
 
 		 471 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5131  cupin 2 domain-containing protein  39.29 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720465  normal  0.658143 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0656  mannose-6-phosphate isomerase  33.33 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.425576  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2267  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  32.95 
 
 		 472 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13508  hypothetical protein  33.33 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1804  cupin 2 domain-containing protein  35.16 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.201717 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1033  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.35 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.714129  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0266  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.43 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.465169  normal  0.12222 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.93 
 
 		 257 aa  43.9  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>