76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3556 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 169 aa  346  1e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  30.89 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.79 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.06 
 
 		 166 aa  71.2  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6634  cupin 2 domain-containing protein  31.85 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.718615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.88 
 
 		 160 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.24 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.24 
 
 		 204 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  32.62 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  33.9 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3197  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.11 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229687  normal  0.39078 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4406  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.79 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0295153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.4 
 
 		 163 aa  62  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2295  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.87 
 
 		 166 aa  62  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  33.9 
 
 		 171 aa  62  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1864  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.43 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.06 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.399642  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.04 
 
 		 181 aa  60.8  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3503  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.61 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3113  cupin 2 domain-containing protein  34.07 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.487782  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2609  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.64 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  30.33 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  32.52 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6348  cupin 2 domain-containing protein  32.14 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5545  cupin 2 domain-containing protein  31.34 
 
 		 141 aa  57  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3647  cupin 2 domain-containing protein  34.29 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5299  hypothetical protein  31.71 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  28.03 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4562  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.12 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  27.48 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4882  hypothetical protein  28.17 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5062  hypothetical protein  35.16 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3620  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.33 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5084  cupin superfamily protein  34.82 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0259637  normal  0.536671 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0565  hypothetical protein  26.02 
 
 		 155 aa  51.6  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.52627 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.29 
 
 		 149 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3405  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.52 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.65 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.34 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2309  hypothetical protein  33.63 
 
 		 139 aa  50.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.5332  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5854  cupin 2 domain-containing protein  34.04 
 
 		 137 aa  49.3  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.154077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6281  hypothetical protein  32.11 
 
 		 149 aa  48.9  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0144  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 165 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2141  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.65 
 
 		 159 aa  47.8  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0204  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.73 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0483  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.319109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3608  cupin 2 domain-containing protein  30.21 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  31.58 
 
 		 150 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  28.35 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3707  cupin 2, barrel  30.09 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.602346 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  32.43 
 
 		 148 aa  45.8  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2685  hypothetical protein  30.56 
 
 		 152 aa  45.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal  0.254874 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4993  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.72 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4239  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.08 
 
 		 163 aa  45.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.637233  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0378  cupin region  33.04 
 
 		 153 aa  44.7  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930622  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3067  cupin 2 domain-containing protein  27.41 
 
 		 145 aa  44.7  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2781  cupin 2, barrel  26.43 
 
 		 338 aa  44.3  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.402218  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3501  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.16 
 
 		 184 aa  44.3  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.43 
 
 		 135 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0595  cupin 2 domain-containing protein  31.37 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0617  cupin 2 domain-containing protein  31.37 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3153  cupin 2 domain-containing protein  34.78 
 
 		 135 aa  43.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0604  cupin 2, barrel  31.37 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398371  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0884  cupin 2, barrel  26.92 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2148  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.82 
 
 		 133 aa  43.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0024464  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5786  cupin 2 conserved barrel domain protein  29.6 
 
 		 135 aa  42.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242076  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1662  cupin 2 domain-containing protein  29.55 
 
 		 108 aa  42.7  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000140317  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0452  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.98 
 
 		 136 aa  42.7  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0837  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.55 
 
 		 130 aa  42.4  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1043  cupin 2 domain-containing protein  25 
 
 		 181 aa  42.7  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0760  cupin 2 domain-containing protein  31.37 
 
 		 178 aa  42.4  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.519438 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4126  cupin 2 domain-containing protein  23.36 
 
 		 119 aa  41.2  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1355  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.43 
 
 		 195 aa  41.6  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.646374  normal  0.0330672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5660  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.17 
 
 		 170 aa  41.6  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.215719 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>