48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3608 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3608  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 159 aa  315  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4562  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.63 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.83 
 
 		 204 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.69 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.83 
 
 		 204 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  30 
 
 		 171 aa  54.3  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3503  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.85 
 
 		 182 aa  53.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.19 
 
 		 165 aa  50.4  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5299  hypothetical protein  34.38 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0144  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 165 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  34.15 
 
 		 163 aa  47.8  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.1 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.51 
 
 		 181 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.14 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  34.34 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5062  hypothetical protein  34 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0747  cupin-like protein  39.77 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3620  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.72 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2471  mannose-6-phosphate isomerase, type II:cupin region  25.86 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4882  hypothetical protein  27.27 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0760  cupin 2 domain-containing protein  32.99 
 
 		 178 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.519438 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3136  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  30.99 
 
 		 456 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  30.71 
 
 		 190 aa  45.1  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.91 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0454  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.37 
 
 		 356 aa  45.1  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2096  mannose-6-phosphate isomerase  26.05 
 
 		 119 aa  44.7  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6348  cupin 2 domain-containing protein  34.29 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2609  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.7 
 
 		 160 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.629  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2364  mannose-6-phosphate isomerase  24.14 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.960914  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0204  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.92 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3113  cupin 2 domain-containing protein  27.84 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.487782  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2141  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.95 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  32.86 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0604  cupin 2, barrel  31.25 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398371  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  22.45 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.399642  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0617  cupin 2 domain-containing protein  31.25 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0595  cupin 2 domain-containing protein  31.25 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3325  mannose-6-phosphate isomerase, type II  25.21 
 
 		 448 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.321079 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6634  cupin 2 domain-containing protein  32.61 
 
 		 189 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.718615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  32.04 
 
 		 163 aa  41.6  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6281  hypothetical protein  34 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1660  Mannose-6-phosphate isomerase  25.23 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1397  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  30.99 
 
 		 461 aa  41.2  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4287  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  28.24 
 
 		 485 aa  41.2  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.197639 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4050  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 192 aa  41.2  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.52 
 
 		 113 aa  41.2  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3271  mannose-6-phosphate isomerase  26.72 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>