59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0760 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0760  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 
178 aa  363  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.519438 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0144  cupin 2 domain-containing protein  87.27 
 
 
165 aa  286  1e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0604  cupin 2, barrel  83.64 
 
 
165 aa  279  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398371  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0617  cupin 2 domain-containing protein  83.64 
 
 
165 aa  279  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546436  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0595  cupin 2 domain-containing protein  83.03 
 
 
165 aa  278  4e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906672  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5299  hypothetical protein  46.54 
 
 
166 aa  145  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2141  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.84 
 
 
159 aa  142  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5660  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.85 
 
 
170 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.215719 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3405  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.84 
 
 
156 aa  92  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  38.98 
 
 
158 aa  71.2  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.76 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.35 
 
 
192 aa  65.1  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0483  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.68 
 
 
172 aa  63.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.319109  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  36.08 
 
 
190 aa  63.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 
135 aa  62.8  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3153  cupin 2 domain-containing protein  32.29 
 
 
135 aa  62  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0747  cupin-like protein  32.09 
 
 
169 aa  60.8  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1878  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  31.5 
 
 
158 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0087666  normal  0.0137906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2878  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  29.46 
 
 
161 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505096  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  30.43 
 
 
163 aa  58.2  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5545  cupin 2 domain-containing protein  28.44 
 
 
141 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1864  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.21 
 
 
144 aa  55.1  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.41 
 
 
149 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  26.32 
 
 
150 aa  53.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2309  hypothetical protein  30.61 
 
 
139 aa  52  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.5332  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3707  cupin 2, barrel  30.65 
 
 
138 aa  51.6  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.602346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3501  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.63 
 
 
184 aa  49.7  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4406  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.1 
 
 
169 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0295153  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.42 
 
 
163 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  31.96 
 
 
153 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2609  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.47 
 
 
160 aa  48.5  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.629  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0223  cupin 2 domain-containing protein  33.73 
 
 
114 aa  48.1  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.61 
 
 
166 aa  48.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1444  cupin 2 domain-containing protein  33.75 
 
 
132 aa  47.8  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  29.84 
 
 
171 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0565  hypothetical protein  36 
 
 
155 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.52627 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2409  cupin family protein  36.84 
 
 
114 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116838  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0177  cupin 2 domain-containing protein  27.83 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 
160 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3608  cupin 2 domain-containing protein  31.25 
 
 
159 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13649  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4521  hypothetical protein  34.33 
 
 
129 aa  45.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.28 
 
 
204 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6281  hypothetical protein  32.89 
 
 
149 aa  45.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3867  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.11 
 
 
145 aa  45.1  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.468547  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1911  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 
131 aa  45.1  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.997303  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.28 
 
 
204 aa  44.7  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3674  cupin 2 domain-containing protein  32.39 
 
 
131 aa  44.3  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.206207  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.73 
 
 
169 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4715  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.85 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0138  cupin 2 protein  37.68 
 
 
174 aa  44.3  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0109  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.67 
 
 
377 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.146013 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4525  cupin 2 domain-containing protein  37.66 
 
 
147 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2810  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.14 
 
 
191 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.597474  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  29.66 
 
 
179 aa  43.5  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0884  cupin 2, barrel  29.87 
 
 
191 aa  43.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3961  cupin 2 domain-containing protein  27.91 
 
 
174 aa  42  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.5 
 
 
181 aa  42  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3880  cupin 2, barrel  34.62 
 
 
163 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434972  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0652  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.89 
 
 
112 aa  41.6  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>