43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3961 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3961  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 174 aa  369  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0138  cupin 2 protein  74.39 
 
 		 174 aa  273  8e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0819  cupin 2, barrel  66.28 
 
 		 189 aa  241  3.9999999999999997e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.105884  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3572  cupin region  61.8 
 
 		 178 aa  241  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0140245  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4235  cupin 2 domain-containing protein  61.27 
 
 		 179 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4566  cupin 2 domain-containing protein  61.63 
 
 		 175 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0464338  hitchhiker  0.000237614 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4640  Cupin 2 conserved barrel domain protein  61.24 
 
 		 178 aa  235  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.650295  normal  0.123647 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3171  Cupin 2 conserved barrel domain protein  64.42 
 
 		 182 aa  235  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.480255  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4508  Cupin 2 conserved barrel domain protein  61.24 
 
 		 178 aa  235  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4101  cupin 2 domain-containing protein  61.63 
 
 		 175 aa  235  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.170919 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4707  cupin 2 domain-containing protein  61.05 
 
 		 175 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324848  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5593  cupin 2 domain-containing protein  61.05 
 
 		 175 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0614455 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3660  cupin 2, barrel  61.05 
 
 		 175 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.276566  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0177  cupin domain-containing protein  60.47 
 
 		 175 aa  231  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0949  cupin 2 domain-containing protein  63.19 
 
 		 176 aa  231  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7061  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60.47 
 
 		 175 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.985846 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1499  hypothetical protein  59.88 
 
 		 175 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1309  cupin domain-containing protein  59.88 
 
 		 175 aa  231  5e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.3623  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0974  hypothetical protein  59.88 
 
 		 175 aa  231  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1236  cupin domain-containing protein  59.88 
 
 		 175 aa  231  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1334  hypothetical protein  59.88 
 
 		 175 aa  231  5e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0593  hypothetical protein  59.88 
 
 		 175 aa  231  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.133951  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2496  hypothetical protein  59.88 
 
 		 175 aa  231  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0317  hypothetical protein  59.88 
 
 		 177 aa  231  5e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.453914  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3986  cupin 2 domain-containing protein  59.88 
 
 		 175 aa  230  8.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0531133  normal  0.0462942 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1107  hypothetical protein  59.88 
 
 		 175 aa  228  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.049501  normal  0.353862 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3691  cupin 2, barrel  63.19 
 
 		 178 aa  228  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.224723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4109  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.68 
 
 		 172 aa  136  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3109  cupin region  40.4 
 
 		 175 aa  104  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1620  cupin 2 domain-containing protein  33.93 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4085  cupin 2 protein  33.75 
 
 		 324 aa  52  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1112  cupin 2 protein  32.5 
 
 		 340 aa  51.6  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.792724  normal  0.152663 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4294  cupin 2 domain-containing protein  32.5 
 
 		 323 aa  49.7  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.689611 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2945  cupin 2 protein  28.67 
 
 		 177 aa  45.8  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0664771  decreased coverage  0.00000748463 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5793  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.53 
 
 		 141 aa  45.1  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0814644 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1589  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.77 
 
 		 132 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.908983 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2810  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.75 
 
 		 191 aa  42.4  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.597474  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.28 
 
 		 165 aa  42  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0760  cupin 2 domain-containing protein  27.91 
 
 		 178 aa  41.6  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.519438 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0604  cupin 2, barrel  29.89 
 
 		 165 aa  40.8  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398371  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0617  cupin 2 domain-containing protein  29.89 
 
 		 165 aa  40.8  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3139  cupin domain protein  29.29 
 
 		 376 aa  40.8  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.557804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0595  cupin 2 domain-containing protein  29.89 
 
 		 165 aa  40.8  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906672  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>