41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0949 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0949  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 176 aa  368  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3691  cupin 2, barrel  90.34 
 
 		 178 aa  333  5.999999999999999e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.224723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4640  Cupin 2 conserved barrel domain protein  88.3 
 
 		 178 aa  327  4e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.650295  normal  0.123647 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4508  Cupin 2 conserved barrel domain protein  88.3 
 
 		 178 aa  327  4e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3572  cupin region  83.71 
 
 		 178 aa  325  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0140245  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3171  Cupin 2 conserved barrel domain protein  81.93 
 
 		 182 aa  300  7.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.480255  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5593  cupin 2 domain-containing protein  74.25 
 
 		 175 aa  283  8e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0614455 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4707  cupin 2 domain-containing protein  74.25 
 
 		 175 aa  283  8e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324848  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3660  cupin 2, barrel  74.25 
 
 		 175 aa  283  8e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.276566  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4566  cupin 2 domain-containing protein  74.25 
 
 		 175 aa  282  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0464338  hitchhiker  0.000237614 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3986  cupin 2 domain-containing protein  73.65 
 
 		 175 aa  282  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0531133  normal  0.0462942 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4101  cupin 2 domain-containing protein  73.65 
 
 		 175 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.170919 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1107  hypothetical protein  73.05 
 
 		 175 aa  280  9e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.049501  normal  0.353862 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4235  cupin 2 domain-containing protein  73.65 
 
 		 179 aa  279  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2496  hypothetical protein  72.46 
 
 		 175 aa  279  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0317  hypothetical protein  72.46 
 
 		 177 aa  279  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.453914  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1309  cupin domain-containing protein  72.46 
 
 		 175 aa  279  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.3623  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1236  cupin domain-containing protein  72.46 
 
 		 175 aa  279  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0974  hypothetical protein  72.46 
 
 		 175 aa  279  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1334  hypothetical protein  72.46 
 
 		 175 aa  279  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0593  hypothetical protein  72.46 
 
 		 175 aa  279  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.133951  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1499  hypothetical protein  72.46 
 
 		 175 aa  278  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0177  cupin domain-containing protein  71.26 
 
 		 175 aa  273  7e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7061  Cupin 2 conserved barrel domain protein  71.26 
 
 		 175 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.985846 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0138  cupin 2 protein  66.87 
 
 		 174 aa  242  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3961  cupin 2 domain-containing protein  63.19 
 
 		 174 aa  231  4.0000000000000004e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0819  cupin 2, barrel  63.8 
 
 		 189 aa  229  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.105884  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4109  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.44 
 
 		 172 aa  134  6.0000000000000005e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3109  cupin region  37.75 
 
 		 175 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2810  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.67 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.597474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2945  cupin 2 protein  31.43 
 
 		 177 aa  52.4  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0664771  decreased coverage  0.00000748463 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1620  cupin 2 domain-containing protein  31.69 
 
 		 176 aa  52  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1112  cupin 2 protein  28.28 
 
 		 340 aa  45.4  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.792724  normal  0.152663 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4294  cupin 2 domain-containing protein  26.09 
 
 		 323 aa  45.1  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.689611 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1589  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.77 
 
 		 132 aa  45.1  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.908983 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1911  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.26 
 
 		 131 aa  44.7  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.997303  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5793  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.85 
 
 		 141 aa  42.4  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0814644 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3387  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.71 
 
 		 157 aa  41.6  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal  0.219685 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3115  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.71 
 
 		 157 aa  41.6  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.768633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4085  cupin 2 protein  29.69 
 
 		 324 aa  42  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.05 
 
 		 126 aa  41.6  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>