36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4109 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4109  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 172 aa  355  1.9999999999999998e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7061  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.48 
 
 		 175 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.985846 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4235  cupin 2 domain-containing protein  49.08 
 
 		 179 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0177  cupin domain-containing protein  49.07 
 
 		 175 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3171  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.53 
 
 		 182 aa  142  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.480255  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0317  hypothetical protein  49.69 
 
 		 177 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.453914  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1334  hypothetical protein  49.69 
 
 		 175 aa  141  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2496  hypothetical protein  49.69 
 
 		 175 aa  141  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0974  hypothetical protein  49.69 
 
 		 175 aa  141  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1236  cupin domain-containing protein  49.69 
 
 		 175 aa  141  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1309  cupin domain-containing protein  49.69 
 
 		 175 aa  141  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.3623  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0593  hypothetical protein  49.69 
 
 		 175 aa  141  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.133951  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3572  cupin region  46.3 
 
 		 178 aa  141  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0140245  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1499  hypothetical protein  49.07 
 
 		 175 aa  140  8e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4707  cupin 2 domain-containing protein  46.01 
 
 		 175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324848  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4640  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.06 
 
 		 178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.650295  normal  0.123647 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3660  cupin 2, barrel  46.01 
 
 		 175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.276566  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4508  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.06 
 
 		 178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5593  cupin 2 domain-containing protein  46.01 
 
 		 175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0614455 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4101  cupin 2 domain-containing protein  47.74 
 
 		 175 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.170919 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4566  cupin 2 domain-containing protein  47.74 
 
 		 175 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0464338  hitchhiker  0.000237614 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3986  cupin 2 domain-containing protein  45.96 
 
 		 175 aa  137  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0531133  normal  0.0462942 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1107  hypothetical protein  45.4 
 
 		 175 aa  136  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.049501  normal  0.353862 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3961  cupin 2 domain-containing protein  45.68 
 
 		 174 aa  136  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0949  cupin 2 domain-containing protein  44.44 
 
 		 176 aa  134  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3691  cupin 2, barrel  44.3 
 
 		 178 aa  129  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.224723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0138  cupin 2 protein  40.85 
 
 		 174 aa  127  7.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0819  cupin 2, barrel  44.44 
 
 		 189 aa  124  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.105884  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3109  cupin region  37.91 
 
 		 175 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5793  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.11 
 
 		 141 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0814644 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3197  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.86 
 
 		 191 aa  45.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229687  normal  0.39078 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0204  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.21 
 
 		 160 aa  42.4  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0825  cupin 2 domain-containing protein  38.16 
 
 		 136 aa  41.2  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1589  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.87 
 
 		 132 aa  41.2  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.908983 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  29.91 
 
 		 172 aa  41.2  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4993  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.7 
 
 		 137 aa  40.8  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391501  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>