70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0204 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0204  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 160 aa  322  1e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3197  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.74 
 
 		 191 aa  118  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229687  normal  0.39078 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.56 
 
 		 181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.9 
 
 		 186 aa  99.4  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.399642  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3503  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.77 
 
 		 182 aa  99.4  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.37 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3113  cupin 2 domain-containing protein  28.47 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.487782  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  32 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  29.86 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3773  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.13 
 
 		 421 aa  55.1  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.239832  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3620  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.92 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0565  hypothetical protein  29.63 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.52627 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.9 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.17 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5062  hypothetical protein  33.66 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31 
 
 		 192 aa  51.6  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6634  cupin 2 domain-containing protein  29.49 
 
 		 189 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.718615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4562  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.43 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2295  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.43 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.8 
 
 		 204 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29 
 
 		 160 aa  48.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.8 
 
 		 204 aa  48.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2409  cupin family protein  35.53 
 
 		 114 aa  47.8  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116838  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.77 
 
 		 163 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  37.66 
 
 		 163 aa  47.4  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  32.18 
 
 		 163 aa  47.4  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4521  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  47.4  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.73 
 
 		 169 aa  47.4  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4715  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.67 
 
 		 127 aa  47  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50 
 
 		 332 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  33.64 
 
 		 332 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1675  cupin 2, barrel  31.46 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1700  cupin 2 domain-containing protein  31.46 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.792463 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0535  cupin 2 domain-containing protein  31.46 
 
 		 147 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1649  cupin 2 domain-containing protein  31.46 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.316822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0548  cupin 2 domain-containing protein  31.46 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.915131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0630  cupin 2 domain-containing protein  31.46 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5649  cupin 2 domain-containing protein  31.46 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  28 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  35.14 
 
 		 158 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5448  cupin 2, barrel  29.41 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.708388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5845  cupin 2 domain-containing protein  29.41 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2609  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.35 
 
 		 160 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  34.34 
 
 		 171 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5545  cupin 2 domain-containing protein  29.9 
 
 		 141 aa  43.9  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3608  cupin 2 domain-containing protein  36.92 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0320  cupin 2 domain-containing protein  28.21 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.864661  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.21 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0474  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 192 aa  43.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.554508  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4417  cupin:cupin region  35 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4456  hypothetical protein  28.92 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0285903  normal  0.0443513 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2869  hypothetical protein  35.29 
 
 		 112 aa  43.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175305  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0884  cupin 2, barrel  31.58 
 
 		 191 aa  43.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.39 
 
 		 257 aa  42.4  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2878  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  27.59 
 
 		 161 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.22 
 
 		 163 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  28.68 
 
 		 163 aa  42.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4109  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.21 
 
 		 172 aa  42.4  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5012  hypothetical protein  31.15 
 
 		 155 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120588  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00345  cupin domain protein  30.85 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00219915  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6281  hypothetical protein  29.29 
 
 		 149 aa  42  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1659  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.54 
 
 		 108 aa  42  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0109  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.25 
 
 		 377 aa  41.6  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.146013 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0847  cupin 2 domain-containing protein  38.71 
 
 		 116 aa  41.6  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4126  cupin 2 domain-containing protein  36.07 
 
 		 119 aa  41.2  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0485  transcriptional regulator, XRE family  33.96 
 
 		 197 aa  40.8  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000244144  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5793  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.13 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0814644 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.04 
 
 		 115 aa  40.8  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2685  hypothetical protein  26 
 
 		 152 aa  40.8  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal  0.254874 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>