200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1181 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 192 aa  385  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.13 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.13 
 
 		 204 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  40.82 
 
 		 190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  38.93 
 
 		 163 aa  105  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.73 
 
 		 160 aa  104  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 		 165 aa  101  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  42.55 
 
 		 163 aa  91.7  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  41.98 
 
 		 163 aa  91.7  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.1 
 
 		 166 aa  91.7  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4406  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.92 
 
 		 169 aa  84  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0295153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  37.86 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.03 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  33.08 
 
 		 171 aa  77  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.53 
 
 		 159 aa  77.4  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3197  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229687  normal  0.39078 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6348  cupin 2 domain-containing protein  37.69 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  39.45 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.79 
 
 		 169 aa  72.8  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2141  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.16 
 
 		 159 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5062  hypothetical protein  37.74 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0144  cupin 2 domain-containing protein  38.38 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4239  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.26 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.637233  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.66 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.399642  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5299  hypothetical protein  37.5 
 
 		 166 aa  67.8  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3153  cupin 2 domain-containing protein  40.22 
 
 		 135 aa  67  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3405  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.4 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2609  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.64 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3647  cupin 2 domain-containing protein  36.17 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6634  cupin 2 domain-containing protein  35.96 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.718615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0760  cupin 2 domain-containing protein  35.35 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.519438 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0604  cupin 2, barrel  38.96 
 
 		 165 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398371  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3113  cupin 2 domain-containing protein  36.21 
 
 		 174 aa  64.3  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.487782  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0617  cupin 2 domain-containing protein  38.96 
 
 		 165 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0595  cupin 2 domain-containing protein  38.96 
 
 		 165 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0223  cupin 2 domain-containing protein  39.74 
 
 		 114 aa  64.3  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0483  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.49 
 
 		 172 aa  62  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.319109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2295  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.52 
 
 		 166 aa  62  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4562  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.43 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0454  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.33 
 
 		 356 aa  61.6  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0565  hypothetical protein  34.74 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.52627 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.79 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5660  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.79 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.215719 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.04 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4525  cupin 2 domain-containing protein  33.08 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2781  cupin 2, barrel  27.19 
 
 		 338 aa  57.4  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.402218  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0950  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.18 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3608  cupin 2 domain-containing protein  34.69 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13649  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4882  hypothetical protein  25.86 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3503  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.91 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2213  cupin 2 domain-containing protein  34.26 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.971914  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3620  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.95 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  40.26 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.51 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  38.96 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0432  cupin region  39.39 
 
 		 117 aa  54.3  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.583729  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4257  transcriptional regulator, XRE family  33.04 
 
 		 189 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.03 
 
 		 121 aa  54.3  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1447  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.04 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.901222  normal  0.428247 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5545  cupin 2 domain-containing protein  31.5 
 
 		 141 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0747  cupin-like protein  30.89 
 
 		 169 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3707  cupin 2, barrel  33.63 
 
 		 138 aa  53.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.602346 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5084  cupin superfamily protein  42.86 
 
 		 147 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0259637  normal  0.536671 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3067  cupin 2 domain-containing protein  34.85 
 
 		 145 aa  53.5  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1444  cupin 2 domain-containing protein  39.24 
 
 		 132 aa  53.5  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1827  hypothetical protein  35.53 
 
 		 121 aa  52.8  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 		 163 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6281  hypothetical protein  31.53 
 
 		 149 aa  52.8  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.25 
 
 		 146 aa  52.8  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.96 
 
 		 145 aa  52.4  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0356258  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0109  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.66 
 
 		 377 aa  52  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.146013 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4522  transcriptional regulator, XRE family  35.44 
 
 		 188 aa  52  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0681879  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0320  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 146 aa  51.6  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.864661  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0204  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31 
 
 		 160 aa  51.6  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  32.99 
 
 		 134 aa  51.2  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5786  cupin 2 conserved barrel domain protein  36.84 
 
 		 135 aa  51.2  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242076  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2309  hypothetical protein  32.97 
 
 		 139 aa  50.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.5332  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0378  cupin region  37.66 
 
 		 153 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930622  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.83 
 
 		 172 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.814089  normal  0.762073 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0884  cupin 2, barrel  34.09 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  26.61 
 
 		 150 aa  50.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2265  cupin 2 domain-containing protein  41.1 
 
 		 172 aa  50.1  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.97009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2249  cupin 2, barrel  34.83 
 
 		 143 aa  49.3  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2878  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  30.43 
 
 		 161 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  27.78 
 
 		 148 aa  49.7  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0389  cupin 2 domain-containing protein  39.66 
 
 		 122 aa  49.3  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2388  oxalate decarboxylase  33.7 
 
 		 389 aa  48.9  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510235 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1662  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 108 aa  48.9  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000140317  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3501  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.3 
 
 		 184 aa  48.9  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3773  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.34 
 
 		 421 aa  48.9  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.239832  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.28 
 
 		 140 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1864  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.6 
 
 		 144 aa  48.9  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1062  oxalate decarboxylase OxdD  39.53 
 
 		 398 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000538183  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4237  oxalate decarboxylase OxdD  39.53 
 
 		 398 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000976291  hitchhiker  0.0000000132545 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  39.73 
 
 		 172 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.14 
 
 		 159 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.529336 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.61 
 
 		 122 aa  47.4  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438384  normal  0.13585 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1608  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.07 
 
 		 104 aa  47.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104789  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4126  cupin 2 domain-containing protein  34.57 
 
 		 119 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>