167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7008 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  323  4.0000000000000003e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  63.98 
 
 		 163 aa  207  5e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  41.43 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2295  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.22 
 
 		 166 aa  95.1  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.98 
 
 		 192 aa  91.7  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.62 
 
 		 160 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.9 
 
 		 165 aa  83.6  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  35.1 
 
 		 190 aa  78.2  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.14 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.14 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.62 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6634  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 189 aa  72  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.718615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.39 
 
 		 163 aa  70.9  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3647  cupin 2 domain-containing protein  33.93 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4562  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.88 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  34.48 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3620  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.32 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.08 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4406  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.61 
 
 		 169 aa  63.9  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0295153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.54 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2781  cupin 2, barrel  30.77 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.402218  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.58 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4882  hypothetical protein  35.11 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3503  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.41 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.72 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.51 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.52 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0320  cupin 2 domain-containing protein  34.62 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.864661  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2609  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3067  cupin 2 domain-containing protein  35.11 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  34.26 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4239  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.637233  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  34.65 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0109  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.43 
 
 		 377 aa  54.7  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.146013 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3113  cupin 2 domain-containing protein  31.54 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.487782  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1447  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.89 
 
 		 190 aa  53.9  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.901222  normal  0.428247 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3153  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  38.2 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5062  hypothetical protein  31.5 
 
 		 157 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6348  cupin 2 domain-containing protein  32.32 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3858  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.63 
 
 		 133 aa  53.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0565  hypothetical protein  34.29 
 
 		 155 aa  52.4  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.52627 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0884  cupin 2, barrel  31.43 
 
 		 191 aa  52  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0950  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.7 
 
 		 389 aa  52.4  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1355  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 195 aa  52.4  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.646374  normal  0.0330672 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1644  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.88 
 
 		 154 aa  52  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.522674  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0177  cupin 2 domain-containing protein  41.67 
 
 		 148 aa  52  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1350  cupin 2 domain-containing protein  34.57 
 
 		 287 aa  51.6  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.832765  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31 
 
 		 145 aa  51.2  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0356258  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3773  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.37 
 
 		 421 aa  50.8  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.239832  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  27.43 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.56 
 
 		 186 aa  50.4  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.399642  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0950  cupin 2 domain-containing protein  42.42 
 
 		 157 aa  50.8  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4456  hypothetical protein  38.33 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0285903  normal  0.0443513 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1305  cupin 2, barrel  32.89 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0335072  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1662  cupin 2 domain-containing protein  31.58 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000140317  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2161  cupin 2 domain-containing protein  34.72 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0191913  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1488  cupin 2 domain-containing protein  36.36 
 
 		 115 aa  49.7  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00804045  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3787  homogentisate 12-dioxygenase  43.28 
 
 		 407 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0454  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.17 
 
 		 356 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4417  cupin:cupin region  33.87 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4715  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.67 
 
 		 127 aa  48.9  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2309  hypothetical protein  26.5 
 
 		 139 aa  48.5  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.5332  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2228  cupin 2 domain-containing protein  35 
 
 		 166 aa  48.5  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300974 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  34.19 
 
 		 152 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5545  cupin 2 domain-containing protein  36.59 
 
 		 141 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4521  hypothetical protein  33.65 
 
 		 129 aa  48.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3707  cupin 2, barrel  29.29 
 
 		 138 aa  48.1  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.602346 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0440  cupin 2, barrel  30.56 
 
 		 149 aa  48.1  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.351298  normal  0.537185 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5012  hypothetical protein  35.48 
 
 		 155 aa  47.8  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120588  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  31.73 
 
 		 148 aa  47.8  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1043  cupin 2 domain-containing protein  28.04 
 
 		 181 aa  47.4  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  26.92 
 
 		 119 aa  47.4  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5098  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.75 
 
 		 124 aa  47  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6281  hypothetical protein  28.68 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  31.62 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1864  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.31 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2409  cupin family protein  32.99 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116838  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.83 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.67 
 
 		 103 aa  46.2  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.754668  normal  0.233584 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1608  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32 
 
 		 104 aa  46.6  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104789  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4126  cupin 2 domain-containing protein  31.4 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1607  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.69 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.978873  normal  0.178437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5299  hypothetical protein  31.78 
 
 		 166 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2685  hypothetical protein  31.9 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal  0.254874 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2031  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  30.49 
 
 		 478 aa  45.4  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0272076  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4525  cupin 2 domain-containing protein  31.58 
 
 		 147 aa  45.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4491  cupin 2 domain-containing protein  40.91 
 
 		 378 aa  44.7  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0456029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3197  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.27 
 
 		 191 aa  44.7  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229687  normal  0.39078 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5302  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.39 
 
 		 153 aa  44.7  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2134  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  34.67 
 
 		 306 aa  44.3  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  31.25 
 
 		 150 aa  44.3  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4297  cupin 2 domain-containing protein  30.21 
 
 		 144 aa  44.3  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2945  cupin 2 domain-containing protein  35.21 
 
 		 171 aa  44.3  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1005  cupin 2 domain-containing protein  33.9 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1023  cupin 2 domain-containing protein  31.58 
 
 		 120 aa  44.3  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2072  auxin-binding protein, putative  31.51 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0382674  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1499  hypothetical protein  32.14 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0842  cupin 2 domain-containing protein  35.62 
 
 		 188 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5786  cupin 2 conserved barrel domain protein  32.5 
 
 		 135 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242076  normal  0.0379764 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>