86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0381 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 103 aa  213  7e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.754668  normal  0.233584 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1285  cupin region  46.46 
 
 		 113 aa  107  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0266  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.24 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.465169  normal  0.12222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.3 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2148  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.05 
 
 		 133 aa  60.1  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0024464  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2075  cupin region  35.48 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.626152  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.9 
 
 		 112 aa  53.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1504  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 111 aa  53.5  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2411  cupin 2 domain-containing protein  37.18 
 
 		 130 aa  51.6  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1270  hypothetical protein  41.94 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3773  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.09 
 
 		 421 aa  50.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.239832  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_006686  CND04560  expressed protein  36.36 
 
 		 177 aa  49.7  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2286  cupin 2 domain-containing protein  34.62 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1073  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.08 
 
 		 175 aa  48.9  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000222691  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.52 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0905  cupin 2 domain-containing protein  27.47 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.52502  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.57 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05332  AraC-like ligand binding domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14370)  37.93 
 
 		 203 aa  47.8  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.484672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1532  cupin 2 domain-containing protein  34.57 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0971  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.23 
 
 		 166 aa  46.2  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  40.3 
 
 		 158 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  34.67 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  40.43 
 
 		 332 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3512  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.82 
 
 		 126 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2605  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.82 
 
 		 126 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0523242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6281  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1579  TonB box-like  37.31 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0402  bicupin, oxalate decarboxylase family  32.94 
 
 		 404 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.861289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0722  bicupin, oxalate decarboxylase family  34.57 
 
 		 234 aa  45.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2361  cupin 2 protein  31.46 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.877822  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2503  cupin 2, barrel  28.42 
 
 		 202 aa  44.3  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.01258  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2162  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.82 
 
 		 115 aa  44.3  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2200  hypothetical protein  39.68 
 
 		 163 aa  44.7  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.192403 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2409  cupin family protein  26.53 
 
 		 114 aa  44.7  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116838  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1654  hypothetical protein  29.03 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225443  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4399  polyketide synthesis domain protein  28.77 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4402  polyketide synthesis domain-containing protein  28.77 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.155389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4287  polyketide synthesis domain protein  28.77 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.640485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1305  cupin 2, barrel  31.51 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0335072  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4715  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.31 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4317  polyketide synthesis domain protein  28.77 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4469  polyketide synthesis domain-containing protein  28.77 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0371  bicupin, oxalate decarboxylase family  32.94 
 
 		 404 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.571775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.86 
 
 		 172 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1525  oxalate decarboxylase  34.12 
 
 		 408 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0264195 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0320  cupin 2 domain-containing protein  27.66 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.864661  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06210  mannose-6-phosphate isomerase  31.58 
 
 		 140 aa  43.5  0.0009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2662  cupin 2 domain-containing protein  27.69 
 
 		 119 aa  43.5  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0837  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.47 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4521  hypothetical protein  29.21 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1488  cupin 2 domain-containing protein  31.94 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00804045  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.63 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1646  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4149  hypothetical protein  35 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26535  decreased coverage  0.0023385 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  31.75 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0317  hypothetical protein  25.84 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.543351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4456  hypothetical protein  32.88 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0285903  normal  0.0443513 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4592  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.33 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0788  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.35 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0115  transcriptional regulatory protein  36.11 
 
 		 194 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1033  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.63 
 
 		 172 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.714129  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1685  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 141 aa  41.6  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0971  cupin domain-containing protein  27.27 
 
 		 171 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.341283  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0922  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.37 
 
 		 186 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  27.5 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.84 
 
 		 332 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1696  cupin 2 protein  41.38 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2672  hypothetical protein  33.33 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.391613 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2328  cupin region  26.6 
 
 		 167 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.408411  normal  0.388933 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0200  oxalate decarboxylase  35.94 
 
 		 378 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.284083 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4126  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  35.94 
 
 		 658 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2685  hypothetical protein  29.69 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal  0.254874 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5786  cupin 2 conserved barrel domain protein  32.94 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242076  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2908  hypothetical protein  37.04 
 
 		 155 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0698  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.16 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.793931  normal  0.732081 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0177  cupin 2 domain-containing protein  29.23 
 
 		 148 aa  40.4  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  33.9 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1364  hypothetical protein  25.23 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2414  hypothetical protein  40.82 
 
 		 155 aa  40.4  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478977  normal  0.947675 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28660  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  44.19 
 
 		 300 aa  40  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4146  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  29.89 
 
 		 474 aa  40  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.469733 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5567  cupin 2 domain-containing protein  27.38 
 
 		 201 aa  40  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0495662 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1819  hypothetical protein  31.43 
 
 		 114 aa  40  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>