44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0317 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0317  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  271  3e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.543351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1364  hypothetical protein  77.27 
 
 		 135 aa  214  2.9999999999999998e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1654  hypothetical protein  75 
 
 		 134 aa  196  9e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225443  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0905  cupin 2 domain-containing protein  63.36 
 
 		 133 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.52502  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2361  cupin 2 protein  54.55 
 
 		 130 aa  147  5e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.877822  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2075  cupin region  51.52 
 
 		 135 aa  144  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.626152  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0266  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.64 
 
 		 130 aa  120  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.465169  normal  0.12222 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3262  cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  46.46 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.232764  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06210  mannose-6-phosphate isomerase  40.77 
 
 		 140 aa  111  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2328  cupin region  46.09 
 
 		 167 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.408411  normal  0.388933 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3146  cupin 2, barrel  45.3 
 
 		 187 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.972416  normal  0.515896 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1073  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.55 
 
 		 175 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000222691  n/a   
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0005  YrkC  43.41 
 
 		 182 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0922  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.75 
 
 		 186 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2503  cupin 2, barrel  42.62 
 
 		 202 aa  105  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.01258  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2411  cupin 2 domain-containing protein  45.76 
 
 		 130 aa  105  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0006  YrkC  42.62 
 
 		 167 aa  103  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2148  Cupin 2 conserved barrel domain protein  49 
 
 		 133 aa  103  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0024464  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5567  cupin 2 domain-containing protein  42.62 
 
 		 201 aa  101  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0495662 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2716  cupin domain protein  39.53 
 
 		 190 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00607762  normal  0.0576252 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2286  cupin 2 domain-containing protein  45.63 
 
 		 130 aa  99.4  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2607  cupin domain protein  39.53 
 
 		 190 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04560  expressed protein  44.64 
 
 		 177 aa  91.7  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05332  AraC-like ligand binding domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14370)  44.44 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.484672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2863  cupin 2, barrel  34.78 
 
 		 107 aa  50.4  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3232  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.43 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.07 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1043  cupin 2 domain-containing protein  35.29 
 
 		 181 aa  47.4  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10260  cupin domain-containing protein  29.07 
 
 		 94 aa  45.1  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.227794 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2610  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.58 
 
 		 199 aa  43.9  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3512  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.89 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.79 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2605  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.89 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0523242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2409  cupin family protein  28.89 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116838  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.84 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.754668  normal  0.233584 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3661  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.71 
 
 		 218 aa  41.6  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  22.86 
 
 		 150 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  24.24 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0784  cupin 2 domain-containing protein  27.4 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0399886  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.08 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3665  hypothetical protein  32.86 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0265322 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0147  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.15 
 
 		 141 aa  40.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2888  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.07 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  30.77 
 
 		 119 aa  40  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>