30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_5567 on replicon NC_010180
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010180  BcerKBAB4_5567  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 
201 aa  418  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.0495662 
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0005  YrkC  85.16 
 
 
182 aa  324  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0006  YrkC  86.23 
 
 
167 aa  304  7e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0922  Cupin 2 conserved barrel domain protein  77.13 
 
 
186 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2503  cupin 2, barrel  62.5 
 
 
202 aa  226  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.01258  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2716  cupin domain protein  67.15 
 
 
190 aa  204  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00607762  normal  0.0576252 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2607  cupin domain protein  66.42 
 
 
190 aa  203  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1073  Cupin 2 conserved barrel domain protein  64.86 
 
 
175 aa  201  5e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000222691  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06210  mannose-6-phosphate isomerase  51.94 
 
 
140 aa  152  4e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2328  cupin region  52.03 
 
 
167 aa  141  5e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.408411  normal  0.388933 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3262  cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  52.07 
 
 
129 aa  139  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.232764  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3146  cupin 2, barrel  48.8 
 
 
187 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.972416  normal  0.515896 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2361  cupin 2 protein  40.31 
 
 
130 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.877822  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2075  cupin region  45.9 
 
 
135 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.626152  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0317  hypothetical protein  42.86 
 
 
132 aa  98.6  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.543351  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1364  hypothetical protein  43.41 
 
 
135 aa  97.8  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0905  cupin 2 domain-containing protein  36.92 
 
 
133 aa  94.7  7e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.52502  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2411  cupin 2 domain-containing protein  38.1 
 
 
130 aa  89.4  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0266  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.59 
 
 
130 aa  89  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.465169  normal  0.12222 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2286  cupin 2 domain-containing protein  39.47 
 
 
130 aa  86.3  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2148  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.38 
 
 
133 aa  84.3  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0024464  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1654  hypothetical protein  40.52 
 
 
134 aa  84.3  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225443  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04560  expressed protein  35.34 
 
 
177 aa  75.1  0.0000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05332  AraC-like ligand binding domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14370)  33.07 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.484672  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.74 
 
 
146 aa  44.3  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4521  hypothetical protein  26.32 
 
 
129 aa  43.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5854  cupin 2 domain-containing protein  29.69 
 
 
137 aa  42.4  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.154077  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2691  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  30.23 
 
 
501 aa  42.4  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0450701 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4715  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.1 
 
 
127 aa  41.6  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4993  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.69 
 
 
137 aa  41.2  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391501  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>