70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2411 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2411  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 130 aa  265  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2286  cupin 2 domain-containing protein  87.6 
 
 		 130 aa  205  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0266  Cupin 2 conserved barrel domain protein  72.66 
 
 		 130 aa  197  3e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.465169  normal  0.12222 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2148  Cupin 2 conserved barrel domain protein  74.6 
 
 		 133 aa  184  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0024464  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04560  expressed protein  56.14 
 
 		 177 aa  136  1e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05332  AraC-like ligand binding domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14370)  50.44 
 
 		 203 aa  110  6e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.484672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0905  cupin 2 domain-containing protein  48.57 
 
 		 133 aa  107  6e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.52502  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06210  mannose-6-phosphate isomerase  45.87 
 
 		 140 aa  107  7.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1364  hypothetical protein  48.08 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0317  hypothetical protein  45.76 
 
 		 132 aa  104  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.543351  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1654  hypothetical protein  42.72 
 
 		 134 aa  103  9e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225443  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2075  cupin region  44.64 
 
 		 135 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.626152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1073  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.35 
 
 		 175 aa  101  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000222691  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2328  cupin region  48.45 
 
 		 167 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.408411  normal  0.388933 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2361  cupin 2 protein  48.18 
 
 		 130 aa  99.8  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.877822  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0922  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.6 
 
 		 186 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3146  cupin 2, barrel  40.17 
 
 		 187 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.972416  normal  0.515896 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2503  cupin 2, barrel  38.76 
 
 		 202 aa  98.6  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.01258  n/a   
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0005  YrkC  40.98 
 
 		 182 aa  96.7  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3262  cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  47.27 
 
 		 129 aa  95.9  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.232764  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5567  cupin 2 domain-containing protein  37.59 
 
 		 201 aa  92.8  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0495662 
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0006  YrkC  40.68 
 
 		 167 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2716  cupin domain protein  38.94 
 
 		 190 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00607762  normal  0.0576252 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2607  cupin domain protein  39.29 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.25 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.05 
 
 		 126 aa  52  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.18 
 
 		 103 aa  51.2  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.754668  normal  0.233584 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003224  mannose-6-phosphate isomerase  31.18 
 
 		 116 aa  51.2  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2605  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.53 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0523242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  32.05 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3512  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.53 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1816  cupin 2 domain-containing protein  31.51 
 
 		 123 aa  47.4  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.337557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10260  cupin domain-containing protein  28.74 
 
 		 94 aa  47  0.00009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.227794 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.89 
 
 		 118 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2863  cupin 2, barrel  31.33 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  31.76 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1285  cupin region  33.75 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2409  cupin family protein  32.86 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116838  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2619  cupin 2, barrel  35.14 
 
 		 120 aa  44.3  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2852  cupin 2  33.9 
 
 		 156 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1917  hypothetical protein  32.88 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0568  cupin 2 domain-containing protein  30.77 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4126  cupin 2 domain-containing protein  26.83 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33680  Protein of unknown function (DUF861)  33.33 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2906  hypothetical protein  28.05 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.808157  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0223  cupin 2 domain-containing protein  37.14 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0413  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  31.51 
 
 		 480 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1827  hypothetical protein  31.43 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01933  Mannose-1-phosphate guanylyltransferase  25.56 
 
 		 474 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01920  hypothetical protein  25.56 
 
 		 474 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2443  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  28 
 
 		 450 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0118  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  28.95 
 
 		 458 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2392  cupin 2 domain-containing protein  35.48 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.232938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1458  cupin 2 domain-containing protein  32.91 
 
 		 174 aa  41.6  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4993  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.87 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0761  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  27.85 
 
 		 450 aa  41.2  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.176463  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2267  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  28.57 
 
 		 472 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0228  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  29.73 
 
 		 467 aa  41.2  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0199  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  29.73 
 
 		 467 aa  41.2  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.310896  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2162  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.88 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2130  cupin 2, barrel  27.12 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0177  cupin 2 domain-containing protein  27.85 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0544  hypothetical protein, putative phage gene  25.3 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.597495  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.93 
 
 		 172 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.814089  normal  0.762073 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1043  cupin 2 domain-containing protein  35.09 
 
 		 181 aa  40.8  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.77 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2053  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.36 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4274  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.87 
 
 		 150 aa  40  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1904  cupin region  28.21 
 
 		 120 aa  40  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0564  hypothetical protein  28.57 
 
 		 106 aa  40  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>