46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2852 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2852  cupin 2  100 
 
 		 156 aa  314  3e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2392  cupin 2 domain-containing protein  81.15 
 
 		 140 aa  209  9e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.232938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4149  hypothetical protein  64.52 
 
 		 150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26535  decreased coverage  0.0023385 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0147  Cupin 2 conserved barrel domain protein  62.22 
 
 		 141 aa  156  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33680  Protein of unknown function (DUF861)  57.64 
 
 		 147 aa  155  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1085  Cupin 2 conserved barrel domain protein  57.38 
 
 		 168 aa  142  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2501  cupin 2 domain-containing protein  60.55 
 
 		 135 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.342935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2685  cupin 2 domain-containing protein  59.63 
 
 		 134 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477579  hitchhiker  0.0004758 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3333  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50 
 
 		 294 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0663795  normal  0.136427 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.31 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3023  cupin 2, barrel  42.86 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1816  cupin 2 domain-containing protein  31.58 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.337557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  36.36 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0503  oxalate decarboxylase  32.14 
 
 		 418 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1413  oxalate decarboxylase  32.14 
 
 		 418 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00642683  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1331  oxalate decarboxylase  32.14 
 
 		 418 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223306  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1067  oxalate decarboxylase  32.14 
 
 		 418 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209096  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1259  cupin family protein  32.14 
 
 		 418 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0758699  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  29.47 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2575  cupin family protein  32.14 
 
 		 418 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.97464  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0231  oxalate decarboxylase  32.14 
 
 		 418 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.842819  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6281  hypothetical protein  30.68 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5028  cupin 2 domain-containing protein  35.14 
 
 		 210 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1043  cupin 2 domain-containing protein  34.02 
 
 		 181 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2685  hypothetical protein  34.85 
 
 		 152 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal  0.254874 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4126  cupin 2 domain-containing protein  32.26 
 
 		 119 aa  44.3  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.71 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  28.07 
 
 		 137 aa  43.9  0.0009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3716  cupin 2, barrel  33.8 
 
 		 129 aa  43.9  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000701811  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2411  cupin 2 domain-containing protein  33.9 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.32 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 152 aa  43.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1426  cupin family protein  31.25 
 
 		 418 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4588  oxalate decarboxylase  30.48 
 
 		 418 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.576029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2286  cupin 2 domain-containing protein  32.2 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  29.11 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5717  oxalate decarboxylase  30.48 
 
 		 418 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.619712  normal  0.130758 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3780  twin-arginine translocation pathway signal  30.48 
 
 		 418 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.150369  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3304  signal peptide protein  31.87 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0282721  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08099  oxalate decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14610)  27.97 
 
 		 477 aa  41.2  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361819  normal  0.0552946 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4136  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.63 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1235  transcriptional regulator, AraC family  33.85 
 
 		 282 aa  41.2  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.593995  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1525  oxalate decarboxylase  29.66 
 
 		 408 aa  41.2  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0264195 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4841  cupin 2 domain-containing protein  27.93 
 
 		 202 aa  41.2  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1397  cupin 2 domain-containing protein  28.28 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0319163  normal  0.27943 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0320  cupin 2 domain-containing protein  36.23 
 
 		 146 aa  40.8  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.864661  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>