30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2361 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2361  cupin 2 protein  100 
 
 		 130 aa  269  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.877822  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2075  cupin region  73.85 
 
 		 135 aa  206  6e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.626152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0905  cupin 2 domain-containing protein  61.07 
 
 		 133 aa  155  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.52502  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1364  hypothetical protein  53.03 
 
 		 135 aa  144  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0317  hypothetical protein  54.55 
 
 		 132 aa  140  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.543351  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1654  hypothetical protein  54.55 
 
 		 134 aa  135  1e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225443  n/a   
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0005  YrkC  44.53 
 
 		 182 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0006  YrkC  43.09 
 
 		 167 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0922  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.4 
 
 		 186 aa  114  6e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5567  cupin 2 domain-containing protein  40.31 
 
 		 201 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0495662 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1073  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.53 
 
 		 175 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000222691  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3262  cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  44.09 
 
 		 129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.232764  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2503  cupin 2, barrel  43.8 
 
 		 202 aa  107  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.01258  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2716  cupin domain protein  39.68 
 
 		 190 aa  105  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00607762  normal  0.0576252 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0266  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.3 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.465169  normal  0.12222 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2148  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50 
 
 		 133 aa  103  8e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0024464  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2607  cupin domain protein  38.4 
 
 		 190 aa  100  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2411  cupin 2 domain-containing protein  48.57 
 
 		 130 aa  96.7  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2328  cupin region  42.34 
 
 		 167 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.408411  normal  0.388933 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2286  cupin 2 domain-containing protein  48.08 
 
 		 130 aa  93.2  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06210  mannose-6-phosphate isomerase  38.1 
 
 		 140 aa  90.5  7e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04560  expressed protein  36.59 
 
 		 177 aa  89.4  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3146  cupin 2, barrel  38.02 
 
 		 187 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.972416  normal  0.515896 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05332  AraC-like ligand binding domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14370)  36.79 
 
 		 203 aa  80.9  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.484672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.46 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.754668  normal  0.233584 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.36 
 
 		 128 aa  43.5  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  29.21 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4274  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.89 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1579  TonB box-like  46 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1827  hypothetical protein  26.6 
 
 		 121 aa  40.4  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>