72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND04560 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006686  CND04560  expressed protein  100 
 
 		 177 aa  360  5.0000000000000005e-99  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0266  Cupin 2 conserved barrel domain protein  57.72 
 
 		 130 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.465169  normal  0.12222 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05332  AraC-like ligand binding domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14370)  54.68 
 
 		 203 aa  148  5e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.484672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2148  Cupin 2 conserved barrel domain protein  61.54 
 
 		 133 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0024464  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2286  cupin 2 domain-containing protein  52.31 
 
 		 130 aa  122  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2411  cupin 2 domain-containing protein  56.57 
 
 		 130 aa  120  8e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2075  cupin region  40.94 
 
 		 135 aa  101  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.626152  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1654  hypothetical protein  43.1 
 
 		 134 aa  99.8  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225443  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3146  cupin 2, barrel  39.06 
 
 		 187 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.972416  normal  0.515896 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2328  cupin region  39.06 
 
 		 167 aa  92  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.408411  normal  0.388933 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0905  cupin 2 domain-containing protein  43.97 
 
 		 133 aa  91.7  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.52502  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2361  cupin 2 protein  36.59 
 
 		 130 aa  89.4  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.877822  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0317  hypothetical protein  44.66 
 
 		 132 aa  87.4  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.543351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06210  mannose-6-phosphate isomerase  39.66 
 
 		 140 aa  86.3  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1364  hypothetical protein  39.25 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2503  cupin 2, barrel  36.94 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.01258  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0922  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.94 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0005  YrkC  37.61 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0006  YrkC  39.09 
 
 		 167 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1073  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.14 
 
 		 175 aa  75.9  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000222691  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5567  cupin 2 domain-containing protein  35.34 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0495662 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3262  cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  38.89 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.232764  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2716  cupin domain protein  33.33 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00607762  normal  0.0576252 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2607  cupin domain protein  33.33 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.3 
 
 		 146 aa  52.4  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 		 103 aa  49.7  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.754668  normal  0.233584 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.14 
 
 		 126 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1496  mannose-6-phosphate isomerase type II  32.1 
 
 		 126 aa  48.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1523  mannose-6-phosphate isomerase type II  32.1 
 
 		 126 aa  48.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1827  hypothetical protein  36.56 
 
 		 121 aa  47.8  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10260  cupin domain-containing protein  32.14 
 
 		 94 aa  46.6  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.227794 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1285  cupin region  30.34 
 
 		 113 aa  45.8  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3623  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.38 
 
 		 122 aa  45.4  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03110  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  45.4  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.050196  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01933  Mannose-1-phosphate guanylyltransferase  35.38 
 
 		 474 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0495  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  29.91 
 
 		 460 aa  45.1  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01920  hypothetical protein  35.38 
 
 		 474 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4274  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.32 
 
 		 150 aa  45.1  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3325  mannose-6-phosphate isomerase type II  26.21 
 
 		 133 aa  44.3  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2619  cupin 2, barrel  31.82 
 
 		 120 aa  43.9  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.23 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1927  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  24.39 
 
 		 477 aa  43.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.328614  normal  0.35544 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.24 
 
 		 112 aa  43.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2471  mannose-6-phosphate isomerase, type II:cupin region  26.32 
 
 		 126 aa  43.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1329  mannose-6-phosphate isomerase  36 
 
 		 112 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0501  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3618  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.36 
 
 		 153 aa  43.5  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.471134  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0761  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  30.86 
 
 		 450 aa  43.5  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.176463  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2663  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  31.17 
 
 		 478 aa  43.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0379621  normal  0.348571 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3271  mannose-6-phosphate isomerase  26.92 
 
 		 121 aa  43.5  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0471  mannose-6-phosphate isomerase  30.86 
 
 		 136 aa  42.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.663561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2044  hypothetical protein  35.71 
 
 		 128 aa  42.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2965  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  31.43 
 
 		 482 aa  42.4  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000470306 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  37.7 
 
 		 137 aa  42.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.12 
 
 		 192 aa  41.6  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2338  mannose-1-phosphate guanylyltransferase  31.17 
 
 		 478 aa  42  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  26.53 
 
 		 472 aa  41.6  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.218624 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.23 
 
 		 172 aa  41.6  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.814089  normal  0.762073 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2445  mannose-1-phosphate guanylyltransferase  31.17 
 
 		 478 aa  41.6  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324867 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2230  mannose-1-phosphate guanylyltransferase  31.17 
 
 		 478 aa  42  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2331  mannose-1-phosphate guanylyltransferase  31.17 
 
 		 478 aa  42  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.167233 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2287  mannose-1-phosphate guanylyltransferase  31.17 
 
 		 478 aa  42  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00436 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1474  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  42  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.208655  normal  0.292696 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0456  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  27.5 
 
 		 471 aa  42  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1292  mannose-6-phosphate isomerase type II  37.04 
 
 		 140 aa  41.6  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0017175  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0656  mannose-6-phosphate isomerase  30.86 
 
 		 139 aa  41.2  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.425576  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0901  Mannose-6-phosphate isomerase  24.68 
 
 		 125 aa  41.2  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3587600000000004e-33 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4235  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  22.88 
 
 		 470 aa  41.2  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.444955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2443  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  28.4 
 
 		 450 aa  41.2  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2891  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  25.49 
 
 		 479 aa  41.2  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.232299 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1366  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  23.33 
 
 		 480 aa  40.8  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3293  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  25.49 
 
 		 479 aa  41.2  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.448941  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0403  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  28.95 
 
 		 472 aa  40.8  0.01  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>