31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1364 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1364  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  278  1e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0317  hypothetical protein  77.27 
 
 		 132 aa  201  4e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.543351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0905  cupin 2 domain-containing protein  60.31 
 
 		 133 aa  168  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.52502  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1654  hypothetical protein  63.64 
 
 		 134 aa  166  9e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225443  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2075  cupin region  53.79 
 
 		 135 aa  145  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.626152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2361  cupin 2 protein  53.03 
 
 		 130 aa  144  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.877822  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3262  cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  45.67 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.232764  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0266  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50.45 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.465169  normal  0.12222 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1073  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.35 
 
 		 175 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000222691  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0922  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.83 
 
 		 186 aa  107  5e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0005  YrkC  42.64 
 
 		 182 aa  104  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06210  mannose-6-phosphate isomerase  36.15 
 
 		 140 aa  102  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2286  cupin 2 domain-containing protein  47.47 
 
 		 130 aa  101  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2607  cupin domain protein  42.74 
 
 		 190 aa  100  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2148  Cupin 2 conserved barrel domain protein  49.49 
 
 		 133 aa  100  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0024464  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2411  cupin 2 domain-containing protein  47.47 
 
 		 130 aa  100  9e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2716  cupin domain protein  42.31 
 
 		 190 aa  99  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00607762  normal  0.0576252 
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0006  YrkC  40.98 
 
 		 167 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5567  cupin 2 domain-containing protein  43.41 
 
 		 201 aa  97.8  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0495662 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2503  cupin 2, barrel  40.16 
 
 		 202 aa  97.4  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.01258  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2328  cupin region  41.74 
 
 		 167 aa  97.1  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.408411  normal  0.388933 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3146  cupin 2, barrel  39.32 
 
 		 187 aa  93.6  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.972416  normal  0.515896 
 
 
-
 
NC_006686  CND04560  expressed protein  39.25 
 
 		 177 aa  81.6  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05332  AraC-like ligand binding domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14370)  41.67 
 
 		 203 aa  73.9  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.484672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.49 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2863  cupin 2, barrel  30.61 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.73 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2409  cupin family protein  26.09 
 
 		 114 aa  41.6  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116838  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.79 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3773  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 		 421 aa  40.8  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.239832  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.23 
 
 		 103 aa  40.4  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.754668  normal  0.233584 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>