32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1073 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1073  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 175 aa  366  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000222691  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2503  cupin 2, barrel  72.62 
 
 		 202 aa  241  3e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.01258  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0922  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60.48 
 
 		 186 aa  206  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0005  YrkC  64.67 
 
 		 182 aa  202  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2607  cupin domain protein  64.34 
 
 		 190 aa  202  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5567  cupin 2 domain-containing protein  64.86 
 
 		 201 aa  201  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0495662 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2716  cupin domain protein  64.34 
 
 		 190 aa  201  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00607762  normal  0.0576252 
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0006  YrkC  70.23 
 
 		 167 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06210  mannose-6-phosphate isomerase  53.49 
 
 		 140 aa  155  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3262  cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  54.84 
 
 		 129 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.232764  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3146  cupin 2, barrel  50.4 
 
 		 187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.972416  normal  0.515896 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2328  cupin region  50 
 
 		 167 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.408411  normal  0.388933 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0905  cupin 2 domain-containing protein  44.53 
 
 		 133 aa  114  5e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.52502  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2361  cupin 2 protein  44.53 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.877822  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2075  cupin region  41.98 
 
 		 135 aa  111  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.626152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1364  hypothetical protein  44.35 
 
 		 135 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0317  hypothetical protein  43.7 
 
 		 132 aa  104  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.543351  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0266  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.4 
 
 		 130 aa  100  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.465169  normal  0.12222 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2411  cupin 2 domain-containing protein  38.1 
 
 		 130 aa  95.9  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2148  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.95 
 
 		 133 aa  91.7  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0024464  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1654  hypothetical protein  42.86 
 
 		 134 aa  89.7  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225443  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2286  cupin 2 domain-containing protein  37.72 
 
 		 130 aa  89  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04560  expressed protein  35.14 
 
 		 177 aa  75.5  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05332  AraC-like ligand binding domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14370)  26.7 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.484672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.08 
 
 		 103 aa  48.9  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.754668  normal  0.233584 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3665  hypothetical protein  31.07 
 
 		 112 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0265322 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.58 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  31.4 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5786  cupin 2 conserved barrel domain protein  29.33 
 
 		 135 aa  42  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242076  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1816  cupin 2 domain-containing protein  34.83 
 
 		 123 aa  41.6  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.337557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0913  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  26.44 
 
 		 474 aa  40.8  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1738  cupin 2, barrel  26.36 
 
 		 112 aa  40.8  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.39391  normal  0.624976 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>