76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2148 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2148  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 133 aa  270  4.0000000000000004e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0024464  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0266  Cupin 2 conserved barrel domain protein  80.16 
 
 		 130 aa  216  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.465169  normal  0.12222 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2286  cupin 2 domain-containing protein  75 
 
 		 130 aa  181  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2411  cupin 2 domain-containing protein  74.6 
 
 		 130 aa  179  8.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_006686  CND04560  expressed protein  61.54 
 
 		 177 aa  155  2e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05332  AraC-like ligand binding domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14370)  49.59 
 
 		 203 aa  122  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.484672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0905  cupin 2 domain-containing protein  49.57 
 
 		 133 aa  114  6e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.52502  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2075  cupin region  47.66 
 
 		 135 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.626152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06210  mannose-6-phosphate isomerase  42.62 
 
 		 140 aa  107  4.0000000000000004e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2361  cupin 2 protein  48.67 
 
 		 130 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.877822  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1364  hypothetical protein  49.53 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1654  hypothetical protein  46 
 
 		 134 aa  104  5e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225443  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0317  hypothetical protein  49 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.543351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1073  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.59 
 
 		 175 aa  99  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000222691  n/a   
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0005  YrkC  41.46 
 
 		 182 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2503  cupin 2, barrel  38.98 
 
 		 202 aa  96.7  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.01258  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0922  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.34 
 
 		 186 aa  94.7  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2328  cupin region  46.08 
 
 		 167 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.408411  normal  0.388933 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3146  cupin 2, barrel  39.13 
 
 		 187 aa  93.6  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.972416  normal  0.515896 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3262  cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  44.55 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.232764  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0006  YrkC  40.68 
 
 		 167 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5567  cupin 2 domain-containing protein  40.18 
 
 		 201 aa  89.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0495662 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2716  cupin domain protein  36.94 
 
 		 190 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00607762  normal  0.0576252 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2607  cupin domain protein  40.18 
 
 		 190 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.1 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.05 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.754668  normal  0.233584 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.05 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003224  mannose-6-phosphate isomerase  30.23 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1285  cupin region  32.58 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2443  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  32 
 
 		 450 aa  48.1  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2619  cupin 2, barrel  28.57 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1816  cupin 2 domain-containing protein  30.14 
 
 		 123 aa  47.4  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.337557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10260  cupin domain-containing protein  32.91 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.227794 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3512  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.34 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2605  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.34 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0523242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1474  hypothetical protein  37.66 
 
 		 154 aa  47  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.208655  normal  0.292696 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0544  hypothetical protein, putative phage gene  27.91 
 
 		 116 aa  47  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.597495  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  32.05 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  29.87 
 
 		 150 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4274  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.63 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  33.33 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4126  cupin 2 domain-containing protein  27.85 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0177  cupin 2 domain-containing protein  27.85 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.43 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2249  cupin 2, barrel  26.47 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.14 
 
 		 140 aa  43.5  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1043  cupin 2 domain-containing protein  35.09 
 
 		 181 aa  43.9  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.82 
 
 		 169 aa  43.5  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03110  hypothetical protein  26.67 
 
 		 133 aa  43.5  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.050196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1305  cupin 2, barrel  32.53 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0335072  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0118  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  30.26 
 
 		 458 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2906  hypothetical protein  25.84 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.808157  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  27.36 
 
 		 171 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4456  hypothetical protein  30.38 
 
 		 129 aa  42  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0285903  normal  0.0443513 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4491  cupin 2 domain-containing protein  31.82 
 
 		 378 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0456029  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.71 
 
 		 192 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1662  cupin 2 domain-containing protein  27.54 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000140317  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3716  cupin 2, barrel  24.21 
 
 		 129 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000701811  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2130  cupin 2, barrel  26.74 
 
 		 106 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0761  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  28.95 
 
 		 450 aa  41.6  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.176463  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2162  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.79 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0568  cupin 2 domain-containing protein  32.88 
 
 		 172 aa  41.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2409  cupin family protein  29.21 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116838  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1917  hypothetical protein  33.82 
 
 		 172 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2663  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  28.57 
 
 		 478 aa  41.2  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0379621  normal  0.348571 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2945  cupin 2 domain-containing protein  32.88 
 
 		 171 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1314  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  29.33 
 
 		 476 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.79469  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2265  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 172 aa  40.8  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.97009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.48 
 
 		 163 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2863  cupin 2, barrel  30.14 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1496  mannose-6-phosphate isomerase type II  30 
 
 		 126 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0564  hypothetical protein  25.26 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1523  mannose-6-phosphate isomerase type II  30 
 
 		 126 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33680  Protein of unknown function (DUF861)  30 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2053  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.12 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0028  double-stranded beta-helix-like protein  27.27 
 
 		 112 aa  40  0.01  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>