54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0177 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0177  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 148 aa  303  7e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4715  Cupin 2 conserved barrel domain protein  66.41 
 
 		 127 aa  182  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4456  hypothetical protein  68.85 
 
 		 129 aa  179  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0285903  normal  0.0443513 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3674  cupin 2 domain-containing protein  65.62 
 
 		 131 aa  177  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.206207  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4521  hypothetical protein  67.48 
 
 		 129 aa  176  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3867  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.05 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.468547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3858  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.44 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.36 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  41.67 
 
 		 163 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1816  cupin 2 domain-containing protein  32.29 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.337557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0144  cupin 2 domain-containing protein  29.46 
 
 		 165 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.83 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0266  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.465169  normal  0.12222 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1043  cupin 2 domain-containing protein  30.69 
 
 		 181 aa  48.9  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0595  cupin 2 domain-containing protein  27.05 
 
 		 165 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0617  cupin 2 domain-containing protein  27.05 
 
 		 165 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1034  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 181 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000342515  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0604  cupin 2, barrel  27.05 
 
 		 165 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398371  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0079  DNA-binding protein  25.6 
 
 		 191 aa  47.8  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5131  cupin 2 domain-containing protein  30.58 
 
 		 155 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720465  normal  0.658143 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0760  cupin 2 domain-containing protein  28.69 
 
 		 178 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.519438 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0837  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.21 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2053  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.67 
 
 		 118 aa  45.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5854  cupin 2 domain-containing protein  29.41 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.154077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2148  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.5 
 
 		 133 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0024464  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0837  cupin 2 domain-containing protein  30.34 
 
 		 125 aa  44.3  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168826 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3273  cupin 2 domain-containing protein  29.75 
 
 		 155 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2409  cupin family protein  34.72 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116838  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0925  transcriptional regulator, XRE family  34.57 
 
 		 205 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5299  hypothetical protein  31.67 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  32.79 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1595  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.91 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.040843 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1434  transcriptional regulator, XRE family  29.23 
 
 		 232 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.887851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  24.76 
 
 		 186 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0937  hypothetical protein  36.26 
 
 		 170 aa  41.2  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2249  cupin 2, barrel  28.57 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4993  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.67 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  22.83 
 
 		 186 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0320  cupin 2 domain-containing protein  32.79 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.864661  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  21.36 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4820  cupin 2, barrel  33.33 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3346  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.71 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 186 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4169  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2411  cupin 2 domain-containing protein  27.5 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.23 
 
 		 103 aa  40.8  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.754668  normal  0.233584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.73 
 
 		 181 aa  40.8  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.91 
 
 		 160 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0832  cupin 2 domain-containing protein  35.16 
 
 		 139 aa  40.8  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03563  conserved hypothetical protein  35.94 
 
 		 407 aa  40.4  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.86517  normal  0.801175 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5786  cupin 2 conserved barrel domain protein  32.14 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242076  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06210  mannose-6-phosphate isomerase  34.52 
 
 		 140 aa  40  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01840  transcriptional regulator, XRE family  31.03 
 
 		 182 aa  40  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>