63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0937 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0937  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  352  2e-96  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0832  cupin 2 domain-containing protein  98.56 
 
 		 139 aa  284  2.9999999999999996e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5069  Cupin 2 conserved barrel domain protein  62.22 
 
 		 137 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4554  cupin 2 domain-containing protein  62.96 
 
 		 137 aa  181  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0071761 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5014  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60.74 
 
 		 137 aa  177  4.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0559417  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3039  Cupin 2 conserved barrel domain protein  56.06 
 
 		 137 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0396  Cupin 2 conserved barrel domain protein  57.69 
 
 		 145 aa  160  7e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.337758  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3294  Cupin 2 conserved barrel domain protein  55.3 
 
 		 137 aa  159  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53927  normal  0.0737316 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2368  cupin 2 domain-containing protein  56.25 
 
 		 137 aa  157  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.034272  normal  0.382558 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2215  cupin 2 domain-containing protein  56.49 
 
 		 145 aa  154  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.556926  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3615  cupin 2 domain-containing protein  48.09 
 
 		 136 aa  135  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0243585  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3966  cupin 2 domain-containing protein  48.46 
 
 		 131 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3228  mannose-6-phosphate isomerase  48.46 
 
 		 131 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0153  cupin 2 domain-containing protein  48.53 
 
 		 146 aa  119  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.621652  normal  0.0698288 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0906  cupin region  44.8 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.168616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3657  cupin 2, barrel  42.4 
 
 		 142 aa  110  9e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3461  Cupin 2 conserved barrel domain protein  52.38 
 
 		 130 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430569 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1911  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.44 
 
 		 131 aa  101  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.997303  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.83 
 
 		 127 aa  97.1  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0230076  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4674  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.23 
 
 		 138 aa  92.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6600  cupin 2 domain-containing protein  37.69 
 
 		 138 aa  92  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1493  cupin:cupin region  42.86 
 
 		 155 aa  89.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3018  cupin 2 domain-containing protein  37.1 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.609339  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1173  cupin 2 domain-containing protein  36.67 
 
 		 180 aa  67.4  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0388903  normal  0.0358477 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4843  cupin 2 domain-containing protein  36.67 
 
 		 182 aa  67.4  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.45501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5111  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.29 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1333  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.97 
 
 		 180 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.861025  normal  0.798178 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4894  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.83 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3156  cupin 2 domain-containing protein  36.52 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4209  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.18 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1354  cupin 2, barrel  38.14 
 
 		 169 aa  62  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.688932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2202  hypothetical protein  37.11 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0792  hypothetical protein  37.62 
 
 		 170 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3173  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.62 
 
 		 171 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457718 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5003  cupin 2 domain-containing protein  33.09 
 
 		 168 aa  60.5  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0560  cupin 2 domain-containing protein  37.62 
 
 		 161 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172519  hitchhiker  0.000823195 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3711  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.67 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3463  cupin 2, barrel  38.14 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3387  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.96 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal  0.219685 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4895  cupin 2 domain-containing protein  36.19 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.664893 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2761  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.07 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.668807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3115  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.96 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.768633  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0220  hypothetical protein  35.71 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3473  cupin 2 domain-containing protein  36.46 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.017049  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1382  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.82 
 
 		 169 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336877  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.93 
 
 		 140 aa  51.2  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.43 
 
 		 147 aa  50.8  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.693609  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5642  cupin 2 domain-containing protein  33.66 
 
 		 156 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2140  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.45 
 
 		 288 aa  47.8  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13508  hypothetical protein  30.1 
 
 		 177 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4521  hypothetical protein  35.48 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  42.62 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  34.29 
 
 		 150 aa  43.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4715  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.41 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3674  cupin 2 domain-containing protein  35.16 
 
 		 131 aa  43.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.206207  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0177  cupin 2 domain-containing protein  36.26 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3440  cupin 2 domain-containing protein  30.53 
 
 		 167 aa  42.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1723  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.84 
 
 		 132 aa  42  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.410123  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2908  hypothetical protein  32.56 
 
 		 155 aa  42  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1816  cupin 2 domain-containing protein  28.42 
 
 		 123 aa  42  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.337557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0144  cupin 2 domain-containing protein  36.49 
 
 		 165 aa  41.6  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0389  cupin 2 domain-containing protein  28.72 
 
 		 122 aa  41.2  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0595  cupin 2 domain-containing protein  35.14 
 
 		 165 aa  40.4  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906672  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>