50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0303 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 
147 aa  305  2.0000000000000002e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.693609  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1382  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 
169 aa  85.5  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336877  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2761  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.98 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.668807  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3711  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.07 
 
 
138 aa  82  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5003  cupin 2 domain-containing protein  36.22 
 
 
168 aa  79.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4843  cupin 2 domain-containing protein  36.8 
 
 
182 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.45501  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3473  cupin 2 domain-containing protein  36.07 
 
 
162 aa  77.4  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.017049  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0220  hypothetical protein  39.13 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3156  cupin 2 domain-containing protein  38.89 
 
 
160 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3115  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.31 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.768633  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4895  cupin 2 domain-containing protein  36.07 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.664893 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3387  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.31 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal  0.219685 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1173  cupin 2 domain-containing protein  37.4 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0388903  normal  0.0358477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3018  cupin 2 domain-containing protein  38.14 
 
 
165 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.609339  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1333  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.4 
 
 
180 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.861025  normal  0.798178 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4894  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.59 
 
 
177 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3463  cupin 2, barrel  35.07 
 
 
172 aa  71.2  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0560  cupin 2 domain-containing protein  32.19 
 
 
161 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172519  hitchhiker  0.000823195 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5111  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.29 
 
 
167 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4209  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.33 
 
 
166 aa  70.5  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0792  hypothetical protein  33.33 
 
 
170 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817049  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3173  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 
171 aa  67  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5642  cupin 2 domain-containing protein  36.97 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2202  hypothetical protein  33.64 
 
 
172 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7217  hypothetical protein  30.67 
 
 
206 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.862471  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1354  cupin 2, barrel  36.36 
 
 
169 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.688932  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1911  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.18 
 
 
131 aa  60.1  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.997303  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3461  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 
130 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00430569 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.2 
 
 
127 aa  57.4  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0230076  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1493  cupin:cupin region  34.83 
 
 
155 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2215  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 
145 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.556926  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4554  cupin 2 domain-containing protein  35.24 
 
 
137 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0071761 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0396  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 
145 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.337758  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2368  cupin 2 domain-containing protein  35.9 
 
 
137 aa  53.9  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.034272  normal  0.382558 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5014  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.29 
 
 
137 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0559417  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0832  cupin 2 domain-containing protein  32.38 
 
 
139 aa  53.5  0.0000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5069  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 
137 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666012  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6600  cupin 2 domain-containing protein  35.48 
 
 
138 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0937  hypothetical protein  31.43 
 
 
170 aa  50.8  0.000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0906  cupin region  31.65 
 
 
142 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.168616  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3966  cupin 2 domain-containing protein  30.77 
 
 
131 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3039  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 
137 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4674  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.58 
 
 
138 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3228  mannose-6-phosphate isomerase  30.77 
 
 
131 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2772  cupin 2 domain-containing protein  41.43 
 
 
178 aa  45.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3294  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.4 
 
 
137 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53927  normal  0.0737316 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3657  cupin 2, barrel  31.65 
 
 
142 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3615  cupin 2 domain-containing protein  28.26 
 
 
136 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0243585  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2924  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 
204 aa  40.8  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.705469  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0153  cupin 2 domain-containing protein  38.36 
 
 
146 aa  40  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.621652  normal  0.0698288 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>