49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2215 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2215  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 145 aa  298  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.556926  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0396  Cupin 2 conserved barrel domain protein  88.97 
 
 		 145 aa  270  5.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.337758  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5014  Cupin 2 conserved barrel domain protein  67.16 
 
 		 137 aa  189  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0559417  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4554  cupin 2 domain-containing protein  65.67 
 
 		 137 aa  186  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0071761 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5069  Cupin 2 conserved barrel domain protein  63.43 
 
 		 137 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3294  Cupin 2 conserved barrel domain protein  59.85 
 
 		 137 aa  164  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53927  normal  0.0737316 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3039  Cupin 2 conserved barrel domain protein  59.12 
 
 		 137 aa  161  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3615  cupin 2 domain-containing protein  56.3 
 
 		 136 aa  156  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0243585  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0832  cupin 2 domain-containing protein  56.49 
 
 		 139 aa  155  2e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0937  hypothetical protein  56.49 
 
 		 170 aa  154  3e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2368  cupin 2 domain-containing protein  60.77 
 
 		 137 aa  153  9e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.034272  normal  0.382558 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0153  cupin 2 domain-containing protein  60.31 
 
 		 146 aa  140  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.621652  normal  0.0698288 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3966  cupin 2 domain-containing protein  53.49 
 
 		 131 aa  136  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3228  mannose-6-phosphate isomerase  53.49 
 
 		 131 aa  135  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0906  cupin region  44.12 
 
 		 142 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.168616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3461  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.71 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430569 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3657  cupin 2, barrel  41.18 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1493  cupin:cupin region  42.86 
 
 		 155 aa  95.9  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.4 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0230076  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6600  cupin 2 domain-containing protein  42.45 
 
 		 138 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1911  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.06 
 
 		 131 aa  93.2  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.997303  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4674  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.92 
 
 		 138 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4843  cupin 2 domain-containing protein  34.71 
 
 		 182 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.45501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3156  cupin 2 domain-containing protein  32.59 
 
 		 160 aa  60.1  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1173  cupin 2 domain-containing protein  34.91 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0388903  normal  0.0358477 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0220  hypothetical protein  34.21 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1333  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.91 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.861025  normal  0.798178 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4894  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.96 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3018  cupin 2 domain-containing protein  34.55 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.609339  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3463  cupin 2, barrel  32.73 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3387  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.64 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal  0.219685 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0792  hypothetical protein  33.33 
 
 		 170 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3173  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 171 aa  57  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457718 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0560  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 161 aa  57  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172519  hitchhiker  0.000823195 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5111  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.64 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3115  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.71 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.768633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.693609  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2202  hypothetical protein  28.57 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5003  cupin 2 domain-containing protein  31.5 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4209  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.69 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3473  cupin 2 domain-containing protein  32.69 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.017049  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1354  cupin 2, barrel  30.21 
 
 		 169 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.688932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4895  cupin 2 domain-containing protein  31.06 
 
 		 167 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.664893 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3711  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.02 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1382  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32 
 
 		 169 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336877  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2761  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.84 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.668807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5642  cupin 2 domain-containing protein  27.97 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.24 
 
 		 192 aa  40.4  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.52 
 
 		 140 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>