57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3463 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3463  cupin 2, barrel  100 
 
 		 172 aa  353  5e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4209  Cupin 2 conserved barrel domain protein  86.59 
 
 		 166 aa  291  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2202  hypothetical protein  86.9 
 
 		 172 aa  269  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1354  cupin 2, barrel  75.64 
 
 		 169 aa  250  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.688932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5111  Cupin 2 conserved barrel domain protein  76.4 
 
 		 167 aa  244  4e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3115  Cupin 2 conserved barrel domain protein  73.05 
 
 		 157 aa  242  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.768633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3387  Cupin 2 conserved barrel domain protein  80 
 
 		 157 aa  241  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal  0.219685 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3018  cupin 2 domain-containing protein  74.07 
 
 		 165 aa  240  6e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.609339  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0220  hypothetical protein  75.32 
 
 		 156 aa  239  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4895  cupin 2 domain-containing protein  72.61 
 
 		 167 aa  234  4e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.664893 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5003  cupin 2 domain-containing protein  73.83 
 
 		 168 aa  232  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0792  hypothetical protein  72.51 
 
 		 170 aa  230  7.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1333  Cupin 2 conserved barrel domain protein  69.41 
 
 		 180 aa  229  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.861025  normal  0.798178 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1173  cupin 2 domain-containing protein  69.41 
 
 		 180 aa  229  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0388903  normal  0.0358477 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3473  cupin 2 domain-containing protein  74.48 
 
 		 162 aa  228  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.017049  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4843  cupin 2 domain-containing protein  74.32 
 
 		 182 aa  228  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.45501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3173  Cupin 2 conserved barrel domain protein  71.51 
 
 		 171 aa  226  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457718 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4894  Cupin 2 conserved barrel domain protein  67.86 
 
 		 177 aa  223  7e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0560  cupin 2 domain-containing protein  78.23 
 
 		 161 aa  222  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172519  hitchhiker  0.000823195 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3156  cupin 2 domain-containing protein  65.16 
 
 		 160 aa  204  3e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1382  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.17 
 
 		 169 aa  101  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336877  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5642  cupin 2 domain-containing protein  42.86 
 
 		 156 aa  97.4  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2761  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.68 
 
 		 139 aa  95.5  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.668807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3711  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.57 
 
 		 138 aa  90.9  9e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7217  hypothetical protein  32.68 
 
 		 206 aa  77.8  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.862471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.07 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.693609  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1911  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.21 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.997303  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4554  cupin 2 domain-containing protein  37.11 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0071761 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2772  cupin 2 domain-containing protein  36.45 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5014  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.08 
 
 		 137 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0559417  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.48 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0230076  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3461  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.71 
 
 		 130 aa  62  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430569 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5069  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.05 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3228  mannose-6-phosphate isomerase  32.99 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0832  cupin 2 domain-containing protein  38.14 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3615  cupin 2 domain-containing protein  30.63 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0243585  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3966  cupin 2 domain-containing protein  31.96 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0937  hypothetical protein  38.14 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6600  cupin 2 domain-containing protein  30.77 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2215  cupin 2 domain-containing protein  32.73 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.556926  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0396  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.78 
 
 		 145 aa  57  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.337758  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3098  cupin 2 protein  33.64 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.798535  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1493  cupin:cupin region  25.76 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0571  pectin degradation protein kdgF  32.11 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2453  cupin domain-containing protein  32.11 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0153  cupin 2 domain-containing protein  39.78 
 
 		 146 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.621652  normal  0.0698288 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4674  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.72 
 
 		 138 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2589  pectin degradation protein KdgF  32.11 
 
 		 137 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933509  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0889  hypothetical protein  32.11 
 
 		 169 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0906  cupin region  29.81 
 
 		 142 aa  50.8  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.168616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2368  cupin 2 domain-containing protein  32.99 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.034272  normal  0.382558 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3294  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.93 
 
 		 137 aa  47.8  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53927  normal  0.0737316 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3657  cupin 2, barrel  27.88 
 
 		 142 aa  46.6  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3039  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.9 
 
 		 137 aa  45.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4235  cupin 2 domain-containing protein  35.9 
 
 		 179 aa  40.8  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4101  cupin 2 domain-containing protein  35.9 
 
 		 175 aa  40.8  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.170919 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1499  hypothetical protein  35.9 
 
 		 175 aa  40.8  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>