58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3039 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3039  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 137 aa  283  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3294  Cupin 2 conserved barrel domain protein  96.35 
 
 		 137 aa  273  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53927  normal  0.0737316 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2368  cupin 2 domain-containing protein  72.26 
 
 		 137 aa  218  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.034272  normal  0.382558 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5069  Cupin 2 conserved barrel domain protein  64.23 
 
 		 137 aa  180  7e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4554  cupin 2 domain-containing protein  63.5 
 
 		 137 aa  178  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0071761 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3966  cupin 2 domain-containing protein  62.5 
 
 		 131 aa  176  9e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5014  Cupin 2 conserved barrel domain protein  62.04 
 
 		 137 aa  176  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0559417  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3228  mannose-6-phosphate isomerase  62.5 
 
 		 131 aa  176  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0396  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60.58 
 
 		 145 aa  170  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.337758  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3615  cupin 2 domain-containing protein  60.15 
 
 		 136 aa  166  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0243585  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0832  cupin 2 domain-containing protein  56.82 
 
 		 139 aa  165  2e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0937  hypothetical protein  56.06 
 
 		 170 aa  163  9e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2215  cupin 2 domain-containing protein  59.12 
 
 		 145 aa  161  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.556926  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0906  cupin region  46.83 
 
 		 142 aa  134  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.168616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3657  cupin 2, barrel  44.44 
 
 		 142 aa  128  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0153  cupin 2 domain-containing protein  56.3 
 
 		 146 aa  126  9.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.621652  normal  0.0698288 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3461  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.7 
 
 		 130 aa  120  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430569 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.7 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0230076  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1911  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.31 
 
 		 131 aa  111  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.997303  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1493  cupin:cupin region  44.54 
 
 		 155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6600  cupin 2 domain-containing protein  45.3 
 
 		 138 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4674  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.83 
 
 		 138 aa  101  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3156  cupin 2 domain-containing protein  34.04 
 
 		 160 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1173  cupin 2 domain-containing protein  32.14 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0388903  normal  0.0358477 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4894  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.14 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4843  cupin 2 domain-containing protein  32.14 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.45501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1333  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.14 
 
 		 180 aa  57  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.861025  normal  0.798178 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3018  cupin 2 domain-containing protein  32.73 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.609339  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0792  hypothetical protein  32.74 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5111  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.3 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3173  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.74 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457718 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0560  cupin 2 domain-containing protein  32.74 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172519  hitchhiker  0.000823195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2761  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.57 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.668807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1354  cupin 2, barrel  30.93 
 
 		 169 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.688932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4209  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.93 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0602  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.35 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0220  hypothetical protein  31.13 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3711  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.61 
 
 		 138 aa  47.8  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 147 aa  47.4  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.693609  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1382  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.03 
 
 		 169 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336877  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4895  cupin 2 domain-containing protein  28.3 
 
 		 167 aa  46.2  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.664893 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5003  cupin 2 domain-containing protein  30.85 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2202  hypothetical protein  27.84 
 
 		 172 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3463  cupin 2, barrel  29.9 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3115  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29 
 
 		 157 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.768633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3440  cupin 2 domain-containing protein  29.41 
 
 		 167 aa  43.9  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  29.27 
 
 		 153 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.25 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3387  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.95 
 
 		 157 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal  0.219685 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0389  cupin 2 domain-containing protein  32 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.88 
 
 		 204 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.88 
 
 		 204 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3473  cupin 2 domain-containing protein  28 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.017049  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  37.7 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5786  cupin 2 conserved barrel domain protein  27.12 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242076  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.19 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0571  pectin degradation protein kdgF  33.8 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2046  XRE family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 205 aa  40.4  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298774  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>