58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2202 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2202  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  353  7.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1354  cupin 2, barrel  84.52 
 
 		 169 aa  282  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.688932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3463  cupin 2, barrel  80.72 
 
 		 172 aa  272  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4209  Cupin 2 conserved barrel domain protein  80.62 
 
 		 166 aa  272  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5111  Cupin 2 conserved barrel domain protein  74.23 
 
 		 167 aa  246  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3018  cupin 2 domain-containing protein  72.39 
 
 		 165 aa  242  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.609339  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4895  cupin 2 domain-containing protein  72.78 
 
 		 167 aa  243  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.664893 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4894  Cupin 2 conserved barrel domain protein  71.17 
 
 		 177 aa  240  7e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4843  cupin 2 domain-containing protein  74.17 
 
 		 182 aa  239  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.45501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1333  Cupin 2 conserved barrel domain protein  70.19 
 
 		 180 aa  238  4e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.861025  normal  0.798178 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1173  cupin 2 domain-containing protein  70.19 
 
 		 180 aa  237  5e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0388903  normal  0.0358477 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5003  cupin 2 domain-containing protein  74 
 
 		 168 aa  236  9e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3387  Cupin 2 conserved barrel domain protein  72.96 
 
 		 157 aa  236  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal  0.219685 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3473  cupin 2 domain-containing protein  68.48 
 
 		 162 aa  234  5.0000000000000005e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.017049  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3115  Cupin 2 conserved barrel domain protein  72.73 
 
 		 157 aa  232  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.768633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0560  cupin 2 domain-containing protein  77.03 
 
 		 161 aa  228  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172519  hitchhiker  0.000823195 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0792  hypothetical protein  70.66 
 
 		 170 aa  226  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3173  Cupin 2 conserved barrel domain protein  70.12 
 
 		 171 aa  223  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457718 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0220  hypothetical protein  69.59 
 
 		 156 aa  221  4e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3156  cupin 2 domain-containing protein  64.14 
 
 		 160 aa  201  4e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1382  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.18 
 
 		 169 aa  99.8  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336877  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2761  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.89 
 
 		 139 aa  96.3  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.668807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5642  cupin 2 domain-containing protein  40.48 
 
 		 156 aa  94.7  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3711  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.16 
 
 		 138 aa  88.2  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7217  hypothetical protein  30.72 
 
 		 206 aa  74.3  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.862471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2772  cupin 2 domain-containing protein  39.25 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4554  cupin 2 domain-containing protein  35.05 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0071761 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3461  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.05 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430569 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5014  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.02 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0559417  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.33 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0230076  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.6 
 
 		 147 aa  63.9  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.693609  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3228  mannose-6-phosphate isomerase  32.99 
 
 		 131 aa  62  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0832  cupin 2 domain-containing protein  37.11 
 
 		 139 aa  62  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5069  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.99 
 
 		 137 aa  62  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1911  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.88 
 
 		 131 aa  62  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.997303  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3966  cupin 2 domain-containing protein  31.96 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0937  hypothetical protein  37.11 
 
 		 170 aa  60.8  0.000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6600  cupin 2 domain-containing protein  30.77 
 
 		 138 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3615  cupin 2 domain-containing protein  27.93 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0243585  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1493  cupin:cupin region  27.94 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3098  cupin 2 protein  33.04 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.798535  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2368  cupin 2 domain-containing protein  36.08 
 
 		 137 aa  57  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.034272  normal  0.382558 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0396  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.44 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.337758  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4674  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.88 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2215  cupin 2 domain-containing protein  28.32 
 
 		 145 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.556926  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0906  cupin region  27.88 
 
 		 142 aa  51.6  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.168616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0153  cupin 2 domain-containing protein  36.56 
 
 		 146 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.621652  normal  0.0698288 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3294  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.87 
 
 		 137 aa  48.5  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53927  normal  0.0737316 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0571  pectin degradation protein kdgF  31.88 
 
 		 138 aa  47.4  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3657  cupin 2, barrel  25.96 
 
 		 142 aa  46.6  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3039  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.84 
 
 		 137 aa  45.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2453  cupin domain-containing protein  30.43 
 
 		 137 aa  45.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2589  pectin degradation protein KdgF  30.43 
 
 		 137 aa  44.7  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933509  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0889  hypothetical protein  30.43 
 
 		 169 aa  44.7  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0819  cupin 2 domain-containing protein  29.29 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0389  cupin 2 domain-containing protein  33.01 
 
 		 122 aa  42.7  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  34.78 
 
 		 137 aa  41.6  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2140  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.33 
 
 		 288 aa  41.6  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>