53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3711 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3711  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 138 aa  278  2e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2761  Cupin 2 conserved barrel domain protein  78.03 
 
 		 139 aa  214  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.668807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1382  Cupin 2 conserved barrel domain protein  75.57 
 
 		 169 aa  204  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336877  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5642  cupin 2 domain-containing protein  62.32 
 
 		 156 aa  160  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7217  hypothetical protein  51.45 
 
 		 206 aa  152  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.862471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4843  cupin 2 domain-containing protein  41.86 
 
 		 182 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.45501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1333  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.31 
 
 		 180 aa  100  8e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.861025  normal  0.798178 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1173  cupin 2 domain-containing protein  42.75 
 
 		 180 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0388903  normal  0.0358477 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4894  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.86 
 
 		 177 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3018  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 165 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.609339  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5111  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.31 
 
 		 167 aa  97.4  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3473  cupin 2 domain-containing protein  40.65 
 
 		 162 aa  97.4  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.017049  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0560  cupin 2 domain-containing protein  40.44 
 
 		 161 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172519  hitchhiker  0.000823195 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4895  cupin 2 domain-containing protein  39.23 
 
 		 167 aa  95.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.664893 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5003  cupin 2 domain-containing protein  39.02 
 
 		 168 aa  94.4  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3156  cupin 2 domain-containing protein  40.15 
 
 		 160 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0792  hypothetical protein  41.6 
 
 		 170 aa  93.6  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3173  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.6 
 
 		 171 aa  93.6  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457718 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4209  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 		 166 aa  92.8  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3463  cupin 2, barrel  36.57 
 
 		 172 aa  90.9  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3387  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.33 
 
 		 157 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal  0.219685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2202  hypothetical protein  35.16 
 
 		 172 aa  89.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3115  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.88 
 
 		 157 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.768633  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0220  hypothetical protein  36.76 
 
 		 156 aa  87.4  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1354  cupin 2, barrel  34.4 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.688932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.07 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.693609  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2772  cupin 2 domain-containing protein  38.28 
 
 		 178 aa  76.6  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3615  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0243585  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3228  mannose-6-phosphate isomerase  35.59 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3966  cupin 2 domain-containing protein  35.59 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0937  hypothetical protein  30.67 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0832  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1911  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.73 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.997303  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2368  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.034272  normal  0.382558 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3461  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 130 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430569 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2215  cupin 2 domain-containing protein  33.02 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.556926  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3039  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.61 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0396  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.78 
 
 		 145 aa  47  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.337758  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5069  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.73 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0906  cupin region  30.63 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.168616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4554  cupin 2 domain-containing protein  30.7 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0071761 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5014  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.82 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0559417  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3294  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.69 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53927  normal  0.0737316 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5502  3-hydroxyanthranilate 3,4-dioxygenase  27.27 
 
 		 189 aa  43.5  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 292 aa  41.6  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4674  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3657  cupin 2, barrel  30.63 
 
 		 142 aa  41.2  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02445  3-hydroxyanthranilate 3,4-dioxygenase  37.1 
 
 		 179 aa  40.8  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5139  3-hydroxyanthranilate 3,4-dioxygenase  26.6 
 
 		 199 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0653889 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7641  3-hydroxyanthranilate 3,4-dioxygenase  28.72 
 
 		 190 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3098  cupin 2 protein  27.05 
 
 		 122 aa  40.8  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.798535  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5193  3-hydroxyanthranilate 3,4-dioxygenase  28.72 
 
 		 174 aa  40.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.30223 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1493  cupin:cupin region  31.13 
 
 		 155 aa  40  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>