69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3966 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3966  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 
131 aa  272  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3228  mannose-6-phosphate isomerase  99.24 
 
 
131 aa  270  3e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3294  Cupin 2 conserved barrel domain protein  63.28 
 
 
137 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53927  normal  0.0737316 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3039  Cupin 2 conserved barrel domain protein  62.5 
 
 
137 aa  176  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2368  cupin 2 domain-containing protein  62.02 
 
 
137 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.034272  normal  0.382558 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5069  Cupin 2 conserved barrel domain protein  55.73 
 
 
137 aa  154  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666012  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5014  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.96 
 
 
137 aa  153  9e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0559417  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4554  cupin 2 domain-containing protein  52.67 
 
 
137 aa  149  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0071761 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3615  cupin 2 domain-containing protein  54.2 
 
 
136 aa  147  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0243585  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0396  Cupin 2 conserved barrel domain protein  55.04 
 
 
145 aa  141  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.337758  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2215  cupin 2 domain-containing protein  53.49 
 
 
145 aa  136  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.556926  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0832  cupin 2 domain-containing protein  48.46 
 
 
139 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0937  hypothetical protein  48.46 
 
 
170 aa  134  4e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0906  cupin region  43.65 
 
 
142 aa  128  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.168616  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0153  cupin 2 domain-containing protein  58.27 
 
 
146 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.621652  normal  0.0698288 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3657  cupin 2, barrel  41.27 
 
 
142 aa  122  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.63 
 
 
127 aa  108  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0230076  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3461  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.32 
 
 
130 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00430569 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1911  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.88 
 
 
131 aa  93.6  9e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.997303  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6600  cupin 2 domain-containing protein  41.9 
 
 
138 aa  89  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1493  cupin:cupin region  40.95 
 
 
155 aa  85.9  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4674  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.93 
 
 
138 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1173  cupin 2 domain-containing protein  34.82 
 
 
180 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0388903  normal  0.0358477 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4894  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.82 
 
 
177 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1333  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.93 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.861025  normal  0.798178 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4843  cupin 2 domain-containing protein  33.04 
 
 
182 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.45501  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3156  cupin 2 domain-containing protein  34.78 
 
 
160 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3018  cupin 2 domain-containing protein  34.91 
 
 
165 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.609339  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5111  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.17 
 
 
167 aa  66.6  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0560  cupin 2 domain-containing protein  39.36 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172519  hitchhiker  0.000823195 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3173  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.36 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457718 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0792  hypothetical protein  39.36 
 
 
170 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817049  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3711  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.59 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1354  cupin 2, barrel  34.02 
 
 
169 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.688932  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2761  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.65 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.668807  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2202  hypothetical protein  31.96 
 
 
172 aa  61.6  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5003  cupin 2 domain-containing protein  32.08 
 
 
168 aa  62  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4209  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.99 
 
 
166 aa  60.8  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2589  pectin degradation protein KdgF  33.33 
 
 
137 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933509  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0889  hypothetical protein  33.33 
 
 
169 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3463  cupin 2, barrel  31.96 
 
 
172 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2453  cupin domain-containing protein  33.33 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3115  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.14 
 
 
157 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.768633  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3387  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.14 
 
 
157 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal  0.219685 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4895  cupin 2 domain-containing protein  30.49 
 
 
167 aa  57  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.664893 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0571  pectin degradation protein kdgF  32.04 
 
 
138 aa  57  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3473  cupin 2 domain-containing protein  30.95 
 
 
162 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.017049  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1382  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.48 
 
 
169 aa  54.7  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336877  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0220  hypothetical protein  30.95 
 
 
156 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 
147 aa  47.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.693609  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0602  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.53 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3018  cupin domain-containing protein  28.45 
 
 
120 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.117139  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2260  polyketide synthesis domain protein  28.45 
 
 
120 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0666056 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2982  polyketide synthesis domain protein  28.45 
 
 
120 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2775  cupin 2 domain-containing protein  28.45 
 
 
120 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.108544  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  41.94 
 
 
163 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2981  cupin domain-containing protein  28.45 
 
 
120 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2770  cupin domain-containing protein  28.45 
 
 
120 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2719  hypothetical protein  28.45 
 
 
120 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5642  cupin 2 domain-containing protein  28.71 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2978  polyketide synthesis domain protein  28.45 
 
 
120 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000628046 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  29.13 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3020  polyketide synthesis domain protein  28.45 
 
 
120 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2699  hypothetical protein  28.45 
 
 
120 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.615203  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0389  cupin 2 domain-containing protein  28.21 
 
 
122 aa  42  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.94 
 
 
192 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4521  hypothetical protein  29.03 
 
 
129 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5786  cupin 2 conserved barrel domain protein  29.13 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242076  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1595  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36 
 
 
123 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.040843 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>